单细胞全转录组

单细胞全转录组，是利用随机引物对RNA全长进行测序。 相比传统单细胞测序的oligo dT捕获技术(只能捕获3’或5’端)，单细胞全转录组具有不受样本类型限制的优点，对细胞活性无要求，适用新鲜、冷冻、FFPE各类样本。 单细胞全转录组具有超高通量和高灵敏度的特点，细胞捕获数高、基因检出数均高于传统单细胞测序平台。 除检测基因表达丰度外，单细胞全转录组还能应用于基因突变、基因融合、拷贝数变异、非编码RNA、可变剪接等研究。

目前主流的高通量单细胞（核）转录组平台主要依赖oligo(dT)捕获RNA分子poly(A)尾，不能捕获降解的RNA，因此局限于检测成熟mRNA、新鲜或新鲜冷冻的样本。研究人员一直尝试开发各种不同的方法来克服这些挑战。

与传统单细胞技术相比，snRandom-seq具有更低的双胞率，以及更高的基因检出数，且数据5’-3’覆盖度均一，在单细胞水平、单基因水平的覆盖度高于其他两种FFPE snRNA-seq方法。本文中，利用snRandom-seq方法，作者探究了小鼠以及人类临床肿瘤FFPE样本的细胞异质性，并可进行精细分群以及生物功能预测。由于snRandom-seq可捕获全转录本的全长信息，更适合进行RNA速率分析、非编码RNA分析等。