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单细胞mRNA+单细胞ATAC

10x单细胞Multiome ATAC+mRNA,可以做到对数千个细胞同时分析基因表达和来自同一细胞的染色质可及性。通过同时得到两种数据,提高细胞状态的分辨率,识别差异基因表达的驱动因子,并发现具有相似转录谱但染色质开放性不同的细胞。
  • 月销售:50+订单
  • 样品数量
产品简介
10x单细胞Multiome ATAC+mRNA:可以同时分析来自同一细胞的基因表达(转录组)和染色质可及性(ATAC),细胞数量级最高可达上万。通过对同时得到两种数据进行关联分析,提高细胞状态的分辨率,识别差异基因表达的驱动因子,并发现具有相似转录表达模式但染色质开放性不同的细胞(群)。
产品优势
优势1
高性价比
同一细胞两种结果,最大限度了解样品特征
优势2
方便快捷
半小时内完成核捕获,联合分析简单快捷
优势3
高灵敏度
细胞核捕获率超过65%,同时捕获几百-几千细胞核
优势4
可适性高
可处理细胞系、原代细胞、新鲜样品和冻存样品
技术流程
技术流程
分析流程
样本要求
案例分析
阿尔茨海默病单核染色质可及性和转录组学特征
  • 期刊:Nature Genetics
    影响因子:41.307
    发表时间:2021.07
    技术手段:snATAC-seq&snRNA-seq
    样本来源:健康和AD死者的大脑前额叶皮质的191890个脑组织细胞核
    DOI:10.1038/s41588-021-00894-z
研究背景
人脑由多个异质的细胞亚群组成,神经元和非神经元细胞协同工作,协调着不同细胞类型的生物过程。阿尔茨海默症(AD)等神经退行性疾病以大量神经元丢失为特征并伴有胶质增生,但特定神经元和胶质细胞群在阿尔茨海默症病理生理学中的作用尚不清楚。对AD等复杂疾病的GWAS表明,很大一部分遗传风险来自常见变异向远端调控元件的分配,这些调控元件通常是疾病相关组织中的细胞类型特异性区域。
实验设计
实验结果展示
本研究对AD患者和认知健康对照组脑组织样本中进行了snATAC-seq和snRNA-seq,同时进行转录因子印迹分析,以进一步阐明细胞类型特异性的转录因子调控。这项研究通过确定细胞类型特异性的、可能介导晚期AD的基因调控变化的gl-cCREs,以及在特定细胞类型中可能与这些gl-cCREs结合的转录因子等,为未来研究AD提供了可能的新靶点。
常见问题
生物学重复要不要设置?
图谱类文章可以不做生物学重复(1个样本也可以);临床样本(人)最起码3个生物学重复;模式生物(小鼠、大鼠)尽量做生物学重复。若样本量不足,同一处理也可以混样测序。
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