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宏病毒组

宏病毒组(Metavirome)是某类样本中所有病毒(virus)或病毒类似物(virus-like-particle)及其所携带遗传信息的总称。宏病毒组学(Metaviromic)是在宏基因组学理论的基础上,结合现有的病毒分子生物学检测技术而兴起的一个新的学科分支,直接以环境中所有病毒的遗传物质为研究对象,能够快速准确的鉴定出环境中所有的病毒组成,是一种发现新病毒、 病毒感染预警和控制的有力手段,在病毒的起源和进化模式、遗传多样性和地理分布等研究方面也具有重要意义。
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产品简介
宏病毒组
宏病毒组(Metavirome)是某类样本中所有病毒(virus)或病毒类似物(virus-like-particle)及其所携带遗传信息的总称。宏病毒组学(Metaviromic)是在宏基因组学理论的基础上,结合现有的病毒分子生物学检测技术而兴起的一个新的学科分支,直接以环境中所有病毒的遗传物质为研究对象,能够快速准确的鉴定出环境中所有的病毒组成,是一种发现新病毒、 病毒感染预警和控制的有力手段,在病毒的起源和进化模式、遗传多样性和地理分布等研究方面也具有重要意义。
宏病毒组解决的问题
宏病毒组解决的问题:通过宏病毒学方法在生态框架内对病毒进行研究,可以提供对病毒生态的独特见解,特别是它们的多样性、分布和动态,以及它们与宿主、其他病毒以及非生物和生物环境的相互作用。
产品优势
优势1
分析全面,流程普适性强
涵盖33项宏病毒组主流分析,不仅适用于宏病毒组数据分析,也可用于宏基因组数据中病 毒组的分析
优势2
病毒粒子鉴定更准确
联合使用2款主流病毒鉴定软件,鉴定结果全面准确
优势3
分类学注释更全面
3种病毒分类学注释方法,注释结果更全面
优势4
vOTUs分析随意切换
定义vOTUs,基于更完整的病毒基因组进行数据解析
技术流程
分析流程
部分结果展示
分析组别之间Alpha多样性指数的的差异
指数组间差异检验
应用领域
样本要求
案例分析
深海热液区病毒多样性及其与宿主的相互作用
  • 案例1:深海热液区病毒多样性及其与宿主的相互作用
    期刊:Microbiome
    IF:15.5
    作者单位:自然资源部海洋三所
    发表时间:2022
    DOI: 10.1186/s40168-022-01441-6
深海热液喷口是地球上最极端的环境之一。化能自养微生物作为优势菌在热液生态系统的构建过程中发挥着不可或缺的作用,其生命活动会受到噬菌体(病毒)的影响,当前对影响热液微生物群落的病毒种类和作用机制尚不清楚。作者通过中国大洋科考第38航次,在西北印度洋卡尔斯伯格洋中脊获取了羽流、近底海水和烟囱沉积物等热液区样品,开展热液微生物多样性及宏基因组分析,并整合了来自全球三大洋的八个热液区的宏基因组数据,结合单细胞测序技术和生物信息学方法,首次系统揭示了深海热液病毒的群落结构、生态分布、宿主偏好和辅助代谢潜能。
危重先天性心脏病新生儿早期肠道微生物组的定位:多组学见解及其对宿主代谢和免疫健康的影响
  • 案例2:危重先天性心脏病新生儿早期肠道微生物组的定位:多组学见解及其对宿主代谢和免疫健康的影响
    期刊:Microbiome
    IF:15.5
    作者单位:中国医学科学院阜外医院
    发表时间:2022
    DOI: 10.1186/s40168-022-01437-2
早期肠道微生物组对维持宿主代谢和免疫稳态至关重要。尽管患有严重先天性心脏病(CCHD)的新生儿面临营养不良和免疫失衡的巨大风险,但微生物与CCHD病理生理学的联系仍知之甚少。在这项研究中,我们旨在研究CCHD新生儿的肠道微生物组与代谢组学特征的关系。此外,我们还探讨了CCHD中宿主-微生物相互作用的临床意义。
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