产品简介
群体进化（Population evolution）：研究群体的遗传结构及其变化的规律。应用数学和统计学的方法研究群体中基因和基因型频率变化的规律以及引起这些变化的选择效应、突变效应等。另外通过分析迁移和遗传漂变等对遗传结构的影响来揭示群体进化的机制及演变的历史，关联决定重要经济性状的基因。
产品优势
优势一
四大群体研究方案
种群起源/驯化改良机制/适应性进化机制/种群历史动态，精准定位科学问题
优势二
分析内容全面，满足分析需求
标准分析之外，还可进行选择清除分析、溯源分析、有效种群大小分析等高级分析
优势三
CNS级图表交付，助力文章发表
美吉对结果的交付图表均为高质量CNS配图，助力您发表行业高水平期刊
技术流程
测序流程
样品基因组DNA检测合格后，利用超声波将DNA序列片段化形成随机片段，对片段化的DNA依次进行末端修复、3′端加A、连接测序接头后，再利用磁珠吸附富集长度为350bp左右的片段，经过PCR扩增形成测序文库。建好的文库先进行文库质检，质检合格的文库通过Illumina平台进行上机测序，测序策略为Illumina PE150，总测序读长为300bp。
分析流程
在Illumina测序数据（Raw Data）下机之后，对下机数据进行质量控制，过滤其中低质量的数据，获得高质量的数据（Clean Data）。接下来根据GATK官方推荐的Best Practices流程进行变异检测。之后基于获得的SNP分子标记进一步进行遗传多样性、群体结构、连锁不平衡、选择性消除等遗传进化相关研究。
结果展示
群体结构分析
应用领域
对已知参考基因组的自然群体进行变异检测，然后基于遗传变异研究群体的遗传多样性、遗传结构、基因交流情况等，并通过一定的统计方法和模型推测物种形成机制及群体进化动态等生物学问题。
样本要求
案例分析
经典案例一 染色体水平的参考基因组和群体基因组分析为驯化桑树(Morus alba L)的进化和改良提供了新的思路
Chromosome-level reference genome and population genomic analysis provide insight into the evolution and improvement of domesticated mulberry (Morus alba L)
期刊： Molecular Plant
影响因子：27.5
发表时间：2020.05
技术手段：全基因组重测序
研究方向：驯化桑葚的的环境适应性
文章链接：doi：10.1016/j.molp.2020.05.005 研究结果
本研究通过对来源于多个地区的134个桑树材料进行群体进化分析，探究了不同地区桑树品种的种群结构和核苷酸多样性，以及品种改良过程中与抗病性和环境适应相关的选择事件。
常见问题
如何选择样本？ 研究起源及迁移路线时，需要在全球范围内尽可能多的收集目标野生种、近缘野生种、驯化种；研究驯化改良机制时，需要选取野生型、驯化型样本或地方型、改良型样本；研究适应性进化时，需要选取不同地理环境，不同海拔高度的样本；研究种群历史时，需要在物种的可能起源地以及各个分布区域进行选材。 可对多倍体物种进行分析么？ 目前我们对有参考基因组序列的异源多倍体可进行分析，无参和同源多倍体分析暂时不考虑。 如何推断研究材料可能已经有亚群分化？ 亚群分化主要与两个因素有关：地理隔离，长久的地理隔离使材料发生分化形成单独的亚群；品系差异，在人工驯化条件下，一般70年足够形成一个品系。
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