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植物非靶向代谢组学

植物代谢组学(Plant Metabolomics)属于代谢组学的重要分支之一,是基于质谱的高灵敏度检测技术,以植物为研究对象,研究其在不同生长发育时期或者受到某种外界/内部刺激时,初生代谢物(氨基酸、脂质和碳水化合物等)以及次生代谢产物(生物碱、黄酮和萜类等)的含量变化,并通过生信分析深度挖掘差异代谢物和涉及到的代谢通路,从而揭示关于植物生长发育、遗传育种和抗胁迫等生理机制。
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产品简介
植物代谢组学(Plant Metabolomics)属于代谢组学的重要分支之一,是基于质谱的高灵敏度检测技术,以植物为研究对象,研究其在不同生长发育时期或者受到某种外界/内部刺激时,初生代谢物(氨基酸、脂质和碳水化合物等)以及次生代谢产物(生物碱、黄酮和萜类等)的含量变化,并通过生信分析深度挖掘差异代谢物和涉及到的代谢通路,从而揭示关于植物生长发育、遗传育种和抗胁迫等生理机制。
产品优势
采用QE高分辨质谱仪检测,定性定量更准确
采用超高分辨率Thermo Q-Exactive质谱仪,搭配Vanquish H超高效液相色谱进行植物样本的LC-MS/MS分析。QE超高分辨率可更好降低复杂基质中质量数接近的物质的干扰,使得定量更准确
具有植物样本的个性化提取方案,覆盖植物常见样本类型
具有专门针对植物样本中代谢物的SOP提取方法、且抽提效果好且质量稳定
覆盖植物常见样本类型 (根、茎、叶、花、果实等),平均鉴定量为800-1500种代谢物
采取双柱四针进样模式,检测效果更佳
在原有的检测体系基础上新增了Amide色谱梯度,对于氨基酸、糖类、有机酸等极性物质提供了更好的分离条件,方法的兼容性更强,检测范围更广,检出量更多。
QC质控和多内标的双重质控,确保数据更可靠、更准确
严格的QC质控和多内标(包括同位素内标)质控
全部基于二级谱图比对鉴别
高水平期刊认可的商业化主流搜库软件,保证搜库更高效、更准确
Progenesis QI软件 (3.0版本)
功能强大的植物代谢组学云平台交付,方便客户挖掘生物信息
产品配套植物代谢组学云平台,更方便挖掘生物信息、制作高分文章经典图片
30+数据分析内容,包括基础分析和个性化分析,助力客户挖掘更有效的生物信息
自主创建高质量植物专属数据库,高度覆盖初生和次生代谢物
自建植物专属数据库MJDBPM,含有2万+植物代谢物,高度覆盖初生代谢物 和次生代谢物
科学的植物代谢物分类
美吉的植物代谢自建库在业内的质量排名靠前
技术流程
应用领域
样本要求
案例分析
生菜对Cd和DBDPE联合胁迫的响应机制:生理代谢组学综合分析
  • Response mechanism of lettuce (Lactuca sativa L.) under combined stress of Cd and DBDPE: An integrated physiological and metabolomics analysis
    期刊:Science of total environment
    影响因子:10.753
    发表时间:2022.05
    技术手段:非靶向代谢组学
    研究方向:环境毒理学
    文章链接:doi:10.1016/j.scitotenv.2023.164204
研究背景
DBDPE(十溴二苯乙烷)和Cd(镉)是常见的代表性污染物,在电子废物拆解过程中往往会逐渐排放并积聚在环境中,导致这些污染物的频繁爆发和检测。这两种化学物质联合暴露后对蔬菜的毒性尚未确定。
技术路线
重要结论
重要结论:研究旨在探讨DBDPE和Cd在单独和联合暴露下对生菜生长的毒性效应和代谢机制。发现生菜地下部分对污染物的富集能力和响应远高于地上部分。同时,IBR分析表明,DBDPE+5 mg/L Cd对生菜毒性具有协同作用,而DBDPE+1 mg/L Cd对生菜毒性具有拮抗作用。MDA含量、根系活力和叶绿素含量是生菜对Cd和DBDPE敏感的生物指标。ABC转运途径是两种污染物对生菜影响最显著的代谢途径。这可能与污染物的转运机制密切相关,这将是未来研究的重点综上所述,本研究为了解新型溴化阻燃剂与重金属的环境共暴露毒性及蔬菜的安全性评价提供了理论依据。本研究结果可用于制定有效的策略,以减少蔬菜中污染物的积累,确保农产品的安全。
常见问题
为什么代谢组学生物学重复建议至少 6 个?
代谢组的变化是生物体遗传因素、环境因素、微生物等因素的综合反映,受到外界因素影响较大。为了提高结果可靠性,减小非实验因素的影响,增加生物学重复数是非常有效的方法,同时还能提高多元统计分析模型的质量,一般植物样本建议不少于 6 例。
样品量不足时会有什么影响?
生物样品中很多重要的代谢物含量低,当样品量不足时,提取的代谢物浓度会低于仪器的检测限,进而导致能检出的代谢物种类大大减少。
什么是 QC 样品?有什么作用?
QC(Quality control)是指质控样品,由每个分析样品各取部分混合而成,QC 样品主要用于数据质量控制,评价分析系统稳定性、保证分析结果的可靠性。
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