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常见的蛋白质翻译后修饰过程有泛素化、磷酸化、乙酰化、糖基化等。

常见DIA的同义词有SWATH-MS（Sequential Windowed Acquisition of All Theoretical Fragment Ion ），HRM（Hyper Reaction Monitoring）等，主要区别在于质谱平台，分别是由不同厂家注册的商标。

4D-DIA 蛋白质组学基于timsTOF Pro2仪器平台以及PASEF技术

TIMS（trapped ion mobility spectrometer）捕获离子淌度：是一种离子淌度分析仪，其中离子在气流的推动下向前运动，将离子按大小和形状分开，在离子运动的反方向施加电场，阻滞离子的运动，将离子捕获在特定的位置，然后逐渐降低电场，将离子由大到小逐个释放。

靶向代谢组学（Targeted metabolomics）是对目标明确的代谢产物的检测分析，特别针对一种或几种途径的代谢产物。需要预先筛选出验证确认的代谢物或已鉴定的潜在生物标记物，基于LC-MS/MS或GC-MS平台采用分析标准品开发稳定的检测方法，进行准确的定性定量分析。

平行反应监测（Parallel Reaction Monitoring, PRM）是一种基于高分辨、高精度质谱的离子监视技术，能够对目标蛋白质、目标肽段（如发生翻译后修饰的肽段）进行选择性检测，从而实现对目标蛋白质/肽段进行绝对定量。

非靶向代谢组学（Untargeted Metabolomics）是通过比较对照组和实验组的代谢组，以寻找其代谢谱差异的一种研究方法。

非靶向代谢组学（Untargeted Metabolomics）是通过比较对照组和实验组的代谢组，以寻找其代谢谱差异的一种研究方法。

非标记定量技术(Label free) 是近年来重要的质谱定量方法，用来比较的样品无需昂贵的稳定同位素标签做标记，提取的蛋白直接酶解后经过质谱分析产生数据。

TMT™（Tandem Mass Tag™）是由美国Thermo Scientific公司研发的一种体外标记技术,可做到10个样品（10plex）同时标记分析。两种标记试剂原理类似，可根据实际样本数量随意选择。