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宏基因组binning云分析

使用宏基因组拼接组装获得的contigs进行binning组装,并通过质量评估和筛选,获得高质量的bins。得到的bins,是很多不能在实验室里培养的细菌、古菌或病毒的基因组草图,选择感兴趣的高质量bin进行单菌的基因组组装,并可以在菌株水平上进行基因和功能注释、比较基因组分析、进化分析等。
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宏基因组Binning一站式解决方案

在宏基因组学分析中,根据一定的特征,将来自不同个体的序列(reads或contigs)分离开来的过程即为binning。简单来说就是把宏基因组数据中来自同一菌株的序列聚到一起,得到一个菌株的基因组。

使用宏基因组拼接组装获得的contigs进行binning组装,并通过质量评估和筛选,获得高质量的bins。得到的bins,是很多不能在实验室里培养的细菌、古菌或病毒的基因组草图,选择感兴趣的高质量bin进行单菌的基因组组装,并可以在菌株水平上进行基因和功能注释、比较基因组分析、进化分析等。

Binning分析使我们得以洞察这些无法在实验室培养获得的菌株的生态适应机制,营养互作机制和新陈代谢功能等,可以研究在环境中起重要作用的微生物及其宿主的互作机制、进化机制等。


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