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产品简介

细菌基因组扫描图，通过二代测序平台，获得基因组的序列信息，并在结构基因组学、比较基因组学层面通过同源基因分析、泛基因组分析、基因的水平转移分析等技术手段探究细菌的耐药性、毒力系统、代谢系统、环境适应性、进化与演变历程等

产品优势

优势1: 美吉生物样本抽提成功率高; 强大的核酸制备能力，样本处理经验丰富，实验成功率高

优势2: 细菌基因组云流程交付，分析内容完备，随时随地做交互分析; 10大分析模块，40+项分析内容，全面解析基因组的结构、基因组基础元件、移动元件等信息

优势3: 结合比较基因组云流程和云工具，造福广大细菌基因组科研人员; 借助比较基因组云流程和云工具，发现基因组间的规律，寻找异同，解析进化，筛选候选功能相关基因

优势4: 17种功能数据库注释，深入挖掘功能信息，多角度解释科学问题; 6大通用数据库，11项专用数据库，可在致病性、耐药性、代谢通路或代谢途径等多角度进行功能基因的深入挖掘

优势5: 2022年，细菌基因组客户文章平均IF≥8; 专业的售后服务体系，祝您文章发表一臂之力

技术流程

结果展示

全面展示基因组的特征，包括正、反义链上的基因分布情况、GC含量、基因组岛等

结果展示

应用领域

病原细菌组学研究方案

环境与工业细菌组学研究方案

样本要求

注：详细取样指导，请联系我司技术人员

案例分析

合作案例一红树林新分离的链霉菌HSL-9B对芒果采后炭疽病的生物防治潜力

Biocontrol potential of a newly isolated Streptomyces sp. HSL-9B from mangrove forest on postharvest anthracnose of mango fruit caused by Colletotrichum gloeosporioides
期刊：Food Control
IF：6
发表时间：2022
DOI：10.1016/j.foodcont.2022.108836

研究结果

芒果炭疽病是由Colletotrichum gloeosporioides引起的最严重的采后疾病之一。从红树林土壤中分离并筛选出对C. gloeosporioides具有较强抗抑菌活性的放线菌。根据表型、生化和全基因组测序，将该菌株划分为马来西亚链霉菌（Streptomyces malaysiensis）。S. malaysiensis HSL-9B具有广谱抗真菌活性，其提取物能显著抑制菌丝生长和孢子萌发，减少芒果采后贮藏期间的腐烂。通过对HSL-9B菌株基因组测序，鉴定了参与拮抗作用的次级代谢物的生物合成基因簇（BGC）。气相色谱-质谱法（GC-MS）分析结果显示，12-甲基十三酸是提取物中鉴定出的主要化合物之一。因此，S. malaysiensis HSL-9B是一种重要的生物资源，可用于探索新的天然产物以防治采后疾病。

合作案例二不同生态位弯曲乳杆菌的表型基因型分析：碳水化合物代谢、抗生素耐药性、细菌素、噬菌体片段以及与CRISPR-Cas系统的联系

Phenotype-genotype analysis of Latilactobacills curvatus from different niches: Carbohydrate metabolism, antibiotic resistance, bacteriocin, phage fragments and linkages with CRISPR-Cas systems
期刊：Food Research International
IF：8.1
发表时间：2022
DOI：10.1016/j.foodres.2022.111640

研究结果

对不同生态位分离的弯曲乳杆菌进行基因组测序和比较基因组分析，结果表明弯曲乳杆菌属于封闭型的泛基因组，不同生态位对弯曲乳杆菌的遗传进化影响不大。此外，弯曲乳杆菌的遗传多样性主要表现在碳水化合物利用、抗生素抗性和免疫/竞争相关因子（细菌素操纵子、CRISPR-Cas和噬菌体）上。基因组测序和遗传分析将有助于阐明弯曲乳杆菌的生物技术潜力，同时促进其作为微生物相关疾病保护剂、促进剂和治疗产品的未来发展。