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细菌基因组扫描图

利用二代测序技术,构建Illumina PE(400bp)文库,de novo组装获得基因组扫描图并进行生物信息分析
  • 月销售:100+订单
  • 样品数量
  • 样品来源
  • * 样品类型
    环境样品 组织样品 细胞 血液 DNA RNA
  • * 细菌类型
    革兰氏阳性菌 革兰氏阴性菌
  • * 产品规格
    测序+分析 纯分析
产品简介
细菌基因组扫描图,通过二代测序平台,获得基因组的序列信息,并在结构基因组学、比较基因组学层面通过同源基因分析、泛基因组分析、基因的水平转移分析等技术手段探究细菌的耐药性、毒力系统、代谢系统、环境适应性、进化与演变历程等
产品优势
优势1
美吉生物样本抽提成功率高
强大的核酸制备能力,样本处理经验丰富,实验成功率高
优势2
细菌基因组云流程交付,分析内容完备,随时随地做交互分析
10大分析模块,40+项分析内容,全面解析基因组的结构、基因组基础元件、移动元件等信息
优势3
结合比较基因组云流程和云工具,造福广大细菌基因组科研人员
借助比较基因组云流程和云工具,发现基因组间的规律,寻找异同,解析进化,筛选候选功能相关基因
优势4
17种功能数据库注释,深入挖掘功能信息,多角度解释科学问题
6大通用数据库,11项专用数据库,可在致病性、耐药性、代谢通路或代谢途径等多角度进行功能基因的深入挖掘
优势5
2022年,细菌基因组客户文章平均IF≥8
专业的售后服务体系,祝您文章发表一臂之力
技术流程
结果展示
全面展示基因组的特征,包括正、反义链上的基因分布情况、GC含量、基因组岛等
结果展示
应用领域
病原细菌组学研究方案
环境与工业细菌组学研究方案
样本要求
注:详细取样指导,请联系我司技术人员
案例分析
红树林新分离的链霉菌HSL-9B对芒果采后炭疽病的生物防治潜力
  • Biocontrol potential of a newly isolated Streptomyces sp. HSL-9B from mangrove forest on postharvest anthracnose of mango fruit caused by Colletotrichum gloeosporioides
    期刊:Food Control
    IF:6
    发表时间:2022
    DOI:10.1016/j.foodcont.2022.108836
研究结果
芒果炭疽病是由Colletotrichum gloeosporioides引起的最严重的采后疾病之一。从红树林土壤中分离并筛选出对C. gloeosporioides具有较强抗抑菌活性的放线菌。根据表型、生化和全基因组测序,将该菌株划分为马来西亚链霉菌(Streptomyces malaysiensis)。S. malaysiensis HSL-9B具有广谱抗真菌活性,其提取物能显著抑制菌丝生长和孢子萌发,减少芒果采后贮藏期间的腐烂。通过对HSL-9B菌株基因组测序,鉴定了参与拮抗作用的次级代谢物的生物合成基因簇(BGC)。气相色谱-质谱法(GC-MS)分析结果显示,12-甲基十三酸是提取物中鉴定出的主要化合物之一。因此,S. malaysiensis HSL-9B是一种重要的生物资源,可用于探索新的天然产物以防治采后疾病。
不同生态位弯曲乳杆菌的表型基因型分析:碳水化合物代谢、抗生素耐药性、细菌素、噬菌体片段以及与CRISPR-Cas系统的联系
  • Phenotype-genotype analysis of Latilactobacills curvatus from different niches: Carbohydrate metabolism, antibiotic resistance, bacteriocin, phage fragments and linkages with CRISPR-Cas systems
    期刊:Food Research International
    IF:8.1
    发表时间:2022
    DOI:10.1016/j.foodres.2022.111640
研究结果
对不同生态位分离的弯曲乳杆菌进行基因组测序和比较基因组分析,结果表明弯曲乳杆菌属于封闭型的泛基因组,不同生态位对弯曲乳杆菌的遗传进化影响不大。此外,弯曲乳杆菌的遗传多样性主要表现在碳水化合物利用、抗生素抗性和免疫/竞争相关因子(细菌素操纵子、CRISPR-Cas和噬菌体)上。基因组测序和遗传分析将有助于阐明弯曲乳杆菌的生物技术潜力,同时促进其作为微生物相关疾病保护剂、促进剂和治疗产品的未来发展。
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