案例分析
协同双功能顺磁分离能够有效分离尿液细胞外囊泡和下游磷酸蛋白质组学分析
- 英文题目:Synergistically Bifunctional Paramagnetic Separation Enables Efficient Isolation of Urine Extracellular Vesicles and Downstream Phosphoproteomic Analysis
期刊:ACS Applied Materials & Interfaces IF=9.229 发表时间:2021.1
项目:4D-label free 蛋白组、4D-磷酸化 研究方向:体液外泌体 DOI:10.1021/acsami.0c19400
研究背景
作者开发一个有效的新材料进行体液样本中外泌体的分离,并对不同功能化磁性纳米材料(BiMBs、DspeMBs、TiMBs)富集外泌体效率进行了对比。BiMBs能够高效的分离EV和并进行蛋白质组学和磷酸蛋白质组学分析。 该方法灵敏度高,所需时间比UC(超高速离心)短,易于适应自动化。 通过结合最新的TIMS - PASEF技术,该分析管道为无创生物标志物筛查提供了一个强大的工具,具有巨大的临床前景。
技术路线
重要结论
作者从BiMBs中分离得到3302个蛋白对应的36,262个特异肽段,从TiMBs中分离得到2540个蛋白对应的23,479个特异肽段,从DspeMBs中分离得到1771个蛋白对应的15190个特异肽段,最后从UC中分离得到1705个蛋白对应的10895个特异肽段。BiMBs鉴定了1098个磷酸蛋白对应的3233个磷酸肽,用DspeMBs鉴定了702个磷酸蛋白对应的2260个磷酸肽,用TiMBs无洗脱鉴定了822个磷酸蛋白对应的2277个磷酸肽。 作为对比,UC检测出了对应于1073个磷酸化蛋白的2900个独特的磷酸肽。