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修饰蛋白质组学

生物体中许多至关重要的生命进程不仅由蛋白质的相关丰度控制,还会被各种时空特异分布、可逆的翻译后修饰调控,因此揭示翻译后修饰的发生规律是解析蛋白质复杂多样的生物功能的一个重要前提。 由于蛋白质发生修饰后其分子质量会发生相应的改变,同时质谱能够精确测定蛋白质或多肽分子质量,根据这一特性,将质谱应用于蛋白质翻译后修饰的鉴定。但由于翻译后修饰的蛋白质在样本中含量低且动态范围广,检测前首先需要对修饰蛋白质或肽段进行富集,然后才能进行质谱鉴定。
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产品简介
生物体中许多至关重要的生命进程不仅由蛋白质的相关丰度控制,还会被各种时空特异分布、可逆的翻译后修饰调控,因此揭示翻译后修饰的发生规律是解析蛋白质复杂多样的生物功能的一个重要前提。 由于蛋白质发生修饰后其分子质量会发生相应的改变,同时质谱能够精确测定蛋白质或多肽分子质量,根据这一特性,将质谱应用于蛋白质翻译后修饰的鉴定。但由于翻译后修饰的蛋白质在样本中含量低且动态范围广,检测前首先需要对修饰蛋白质或肽段进行富集,然后才能进行质谱鉴定。常见的蛋白质翻译后修饰过程有泛素化、磷酸化、乙酰化等。
产品优势
优势1
满足不同技术搭配检测需求
可与TMT/iTRAQ, Label free 方法相结合,进行定量研究
优势2
修饰位点精确鉴定
基于高精度、高灵敏度和高分辨率的质谱分析,对修饰位点精确鉴定
优势3
实现大规模修饰位点鉴定分析
可进行单一蛋白修饰位点的鉴定,也可进行大规模的蛋白质组修饰位点的鉴定与分析
优势4
针对性检测,特异性强
具有针对性的样品富集材料和处理标准流程,富集效率高、特异性强,可提高修饰肽段检测效率
优势5
定量更准确
与TMT/iTRAQ技术相结合时,在磷酸化富集前进行标记,避免TiO2富集的不平行对定量结果的干扰,提高定量磷酸化蛋白质组分析的精确度
技术流程
应用领域
样本要求
案例分析
协同双功能顺磁分离能够有效分离尿液细胞外囊泡和下游磷酸蛋白质组学分析
  • 英文题目:Synergistically Bifunctional Paramagnetic Separation Enables Efficient Isolation of Urine Extracellular Vesicles and Downstream Phosphoproteomic Analysis 期刊:ACS Applied Materials & Interfaces IF=9.229 发表时间:2021.1 项目:4D-label free 蛋白组、4D-磷酸化 研究方向:体液外泌体 DOI:10.1021/acsami.0c19400
研究背景
作者开发一个有效的新材料进行体液样本中外泌体的分离,并对不同功能化磁性纳米材料(BiMBs、DspeMBs、TiMBs)富集外泌体效率进行了对比。BiMBs能够高效的分离EV和并进行蛋白质组学和磷酸蛋白质组学分析。 该方法灵敏度高,所需时间比UC(超高速离心)短,易于适应自动化。 通过结合最新的TIMS - PASEF技术,该分析管道为无创生物标志物筛查提供了一个强大的工具,具有巨大的临床前景。
技术路线
重要结论
作者从BiMBs中分离得到3302个蛋白对应的36,262个特异肽段,从TiMBs中分离得到2540个蛋白对应的23,479个特异肽段,从DspeMBs中分离得到1771个蛋白对应的15190个特异肽段,最后从UC中分离得到1705个蛋白对应的10895个特异肽段。BiMBs鉴定了1098个磷酸蛋白对应的3233个磷酸肽,用DspeMBs鉴定了702个磷酸蛋白对应的2260个磷酸肽,用TiMBs无洗脱鉴定了822个磷酸蛋白对应的2277个磷酸肽。 作为对比,UC检测出了对应于1073个磷酸化蛋白的2900个独特的磷酸肽。
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