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4D-label free蛋白质组

我们熟知的蛋白质组学对于蛋白鉴定是通过保留时间(retentiontime)、质荷比(m/z)、离子强度(intensity)这三个维度进行的,4D蛋白质组在此基础之上增加了第四维肽段的碰撞截面积(CCS)--离子淌度(mobility)的分离,重新定义了蛋白质组学的分析标准。 美吉生物4D-label free 蛋白质组学基于timsTOF Pro2仪器平台以及PASEF技术,大幅度的提高质谱扫描速度和检测灵敏度,实现蛋白质组学在鉴定深度、检测周期、定性准确性、稳定性等性能的革命性提升。
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产品简介
我们熟知的蛋白质组学对于蛋白鉴定是通过保留时间(retentiontime)、质荷比(m/z)、离子强度(intensity)这三个维度进行的,4D蛋白质组在此基础之上增加了第四维肽段的碰撞截面积(CCS)--离子淌度(mobility)的分离,重新定义了蛋白质组学的分析标准。美吉生物4D-label free 蛋白质组学基于timsTOF Pro2仪器平台以及PASEF技术,大幅度的提高质谱扫描速度和检测灵敏度,实现蛋白质组学在鉴定深度、检测周期、定性准确性、稳定性等性能的革命性提升。
产品优势
与传统的label free技术相比,4D-label free 采集模式数据采集具有以下优点:
优势1
定性蛋白更准确
离子淌度中对质量差异小的肽段进行区分(离子迁移率不同),实现更精准的鉴定
优势2
鉴定蛋白数更多
相同测试条件下,4D Label free比传统Label free技术检测能力提高50%以上
优势3
定量更稳定
连续进样96针,R2>0.95,CV<5%,定量范围超过3个数量级
技术流程
应用领域
样本要求
案例分析
氟伐他汀减轻人肺细胞SARS-CoV-2感染
  • 英文题目:Fluvastatin mitigates SARS-CoV-2 infection in human lung cells 期刊:iScience IF=5.8 发表时间:2021.11 项目:4D Label free 蛋白质组学 研究方向:SARS-CoV-2疾病 DOI:10.1016/j.isci.2021.103469
研究背景
新冠肺炎患者的临床数据表明,用于治疗高胆固醇血症的他汀类药物可显著降低新冠肺炎患者的死亡率。但他汀类药物是否直接影响病毒复制或通过调节免疫反应影响临床结局尚不清楚。因此作者采用4D-Lable free蛋白质组学探究SARS-CoV-2感染后人肺细胞的蛋白质变化以及他汀类药物处理之后的影响。
技术路线
重要结论
作者用4D-Lablefree技术分析了细胞蛋白质组,总共鉴定出3229种蛋白质。通过差异分析发现,在氟伐他汀治疗后,四种胆固醇生物合成途径酶显著改变,即HMGCR、FD1、SQLE和MSMO1。为了进一步研究每种他汀类药物在SARS-CoV-2感染过程中的调节作用,作者比较了每种实验条件下前40条改变的细胞通路。具体地说,HMGCR、SQLE和FDFT1的表达水平在接受氟伐他汀、辛伐他汀和瑞舒伐他汀治疗后增加,与SARS-CoV-2感染无关(图3E);这强烈表明SARS-CoV-2感染本身并不削弱他汀类药物介导的胆固醇合成抑制。
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