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宏基因组耐药基因分析

耐药基因,又称抗生素抗性基因(Antibiotic resistance genes, ARGs),在微生物中负责编码对于抗生素等药物的抗性功能,赋予微生物抗生素抗性;抗生素的过度使用和滥用导致了耐药基因和抗生素抗性在全球范围内的广泛传播,严重威胁人类健康;除了不断开发新型药物以应对抗生素抗性,从源头研究ARGs出现和传播的机制以及环境行为也有重要意义,将能帮助制定有效的管理和缓解性措施。 宏基因组测序是目前研究耐药基因的一种强有力方法,它能够揭示样本中广泛的ARGs赋存特征,获取更完整的ARGs图谱,构
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产品简介
耐药基因,又称抗生素抗性基因(Antibiotic resistance genes, ARGs),在微生物中负责编码对于抗生素等药物的抗性功能,赋予微生物抗生素抗性;抗生素的过度使用和滥用导致了耐药基因和抗生素抗性在全球范围内的广泛传播,严重威胁人类健康;除了不断开发新型药物以应对抗生素抗性,从源头研究ARGs出现和传播的机制以及环境行为也有重要意义,将能帮助制定有效的管理和缓解性措施。
宏基因组测序是目前研究耐药基因的一种强有力方法,它能够揭示样本中广泛的ARGs赋存特征,获取更完整的ARGs图谱,构建ARGs与微生物之间的关联,为理解ARGs的产生和传播机制及环境行为提供坚实的基础。
产品优势
专业团队打造专属分析流程,围绕ARG进行深入挖掘
全方位解析ARGs的潜在移动性特征和来源,探究ARGs的环境传播机制
序列层面解析ARGs与MGEs、病原宿主的直接关系及相互作用
探究影响ARGs分布和传播的潜在驱动因素,为抑制ARGs的传播提供理论依据
技术流程
分析流程
宏基因组耐药基因分析流程基于宏基因组高通量测序数据,以耐药基因(ARGs)为研究核心,对环境样本中ARGs的分布、丰度变化、传播机制(可移动性)、致病性(携带ARGs的病原菌)和污染来源等进行挖掘,全面解析不同环境中的ARGs图谱,构建ARGs与微生物之间的关联,为理解ARGs的产生和传播机制及环境行为提供坚实的基础。
部分结果展示
解析组别之间ARGs丰度的变化
丰度差异箱线图
应用领域
样本要求
案例分析
世界大河中抗生素耐药性的超级携带者
  • 案例1:世界大河中抗生素耐药性的超级携带者
    期刊:Microbiome
    IF:15.5
    作者单位:北京大学
    发表时间:2022
    DOI:10.1186/s40168-022-01294-z
已有研究发现抗生素耐药组与人类肠道中的核心微生物群有很强的关联,但对于抗生素耐药基因(ARGs)大型河流中的微生物相关联知之甚少;通过构建长江4300公里连续水域和沉积物中ARGs和抗生素耐药微生物的整体模式,作者发现人类病原菌(HPB)在水和沉积物中占ARGs宿主的13.4%和5.9%,但却携带了46%-64%的ARG数目。陆生HPB是河流中ARGs的主要宿主。本研究突出了未来全球河流生态系统ARG相关风险管理中,控制陆生HPB是重中之重。
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