#
#
温馨提醒:图片仅供参考,商品以实物为准

ONT三代宏基因组

ONT三代宏基因组测序是采用三代测序技术对人体、动物等样品中全部微小生物的基因组DNA进行测序,可以解读微生物群体的物种和功能多样性,其长读长的优势在解析可移动元件,分析物种间的基因转移潜力与传播途径方面更具优势。
  • 月销售:60+订单
  • 样品数量
产品简介
ONT三代宏基因组是利用Nanopore测序技术(PromethION ),以特定环境下微生物群体基因组为研究对象,通过生物信息分析获得环境中的基因功能信息和物种组成信息,分析微生物物种多样性和功能多样性,发掘潜在的生物学意义。与二代测序方法相比,基于超长读长的Nanopore测序的三代宏基因组研究可提高组装效果以及注释的准确度和分辨率,实现更准确的微生物物种分类以及更加丰富的功能基因注释。在解析可移动元件,分析物种间的基因转移潜力与传播途径方面更具优势。
产品优势
优势1
读长更长,无扩增偏差
单条序列长度可达Mb水平;直接测序,无需扩增;
优势2
两种测序模式结合,提高准确性
“3+2”测序模式,数据多轮矫正,准确性高;
优势3
深度挖掘基因上下游信息
基于序列注释,获取基因在contig的位置,向基因组结构分析靠拢;
优势4
多角度挖掘功能信息
抗性基因,可移动元件,次级代谢产物基因簇,多种功能数据库注释结果,多角度挖掘功能信息;
技术流程
分析流程
三代下机数据联合二代测序数据,进行多轮矫正,获取较高准确的数据,进行后续一系列的分析。
结果展示
应用领域
样本要求
案例分析
通过长读宏基因组测序揭示未培养南极土壤细菌的生物合成潜力
  • 英文题目:Biosynthetic potential of uncultured Antarctic soil bacteria revealed through long-read metagenomic sequencing
    期刊:The ISME Journal
    影响因子:11.0
    发表时间:2022
    DOI: 10.1186/s40168-022-01294-z
▶日趋严重的抗生素抗性问题使得研究者们将目光转移到可能是新的抗生素来源的未培养细菌上。扩增子测序与短读测序分析表明宏基因组中存在多样化的生物合成基因簇(BGC);本文通过长读长测序从南极土壤中发现千余个BGCs,证明了未被研究过的谱系中的生物合成潜力。
在一个现实世界的减肥饮食计划中,超重或肥胖个体的肠道微生物群的特征:关注拟杆菌2肠型
  • 英文题目:Characterization of the Gut Microbiota in Individuals with Overweight or Obesity during a Real-World Weight Loss Dietary Program: A Focus on the Bacteroides 2 Enterotype
    期刊:Biomedicines
    发表时间:2022
    DOI: 10.3390/biomedicines10010016
▶饮食干预是减肥疗法的基石。在肥胖患者中,一种生物失调的肠道微生物群(GM)的特点是高水平的拟杆菌谱系和低多样性。在一项高蛋白低热量饮食中添加或不添加活微生物(LMP)的减肥研究中,检测了受试者的肠道微生物组成变化。共采集了163名受试者粪便(基线和体重减轻10%状态下),通过三代宏基因组检测分析,结果显示:在基线时,Bact2肠型在严重肥胖和代谢改变的受试者中更普遍。体重减轻后,基线时肠道微生物多样性较低的受试者的多样性增加,Bact2患病率下降,特别是在添加了LMP中。体重减轻后,Akkermansia muciniphila和Parabacteroides distasonis显著增加,Eubacterium rectale、Streptococcus thermophilus和 Bifidobacterial lineages显著减少。结论:基线微生物组组成与体重减轻后肠道微生物多样性和Bact2肠型流行率的差异变化相关。通过检测这些特征可以推动未来的个性化营养努力,朝着更有利的微生物组组成发展。
售前产品咨询
400-660-1216
在线咨询
0在线咨询 普通页面footer