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原核链特异性转录组

利用二代测序技术,构链特异性文库,探究原核生物在某个时期或特定环境条件下转录出来的所有mRNA
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产品简介
原核链特异性转录组通过构建链特异性文库,不仅可以研究原核生物在某个时期或特定环境条件下转录出来的所有mRNA,通过不同时空条件下基因表达的变化,阐述宿主或环境对基因表达的影响,同时还可以深入挖掘基因结构和sRNA信息,发现新的基因或基因表达元件,进一步为基因网络调控研究提供有力支撑
产品优势
优势1
美吉生物RNA提取成功率高
标杆级样品制备流程,样本处理经验丰富,实验成功率高
优势2
构建链特异性文库,数据质量高,表达定量和结构分析更准确
采用链特异性建库,承诺有效数据量,保证数据分析的可靠性
优势3
原核转录组云流程分析内容完备,可自主构建基因集,随时随地做交互分析
10大分析模块,30+项分析内容,自由分组,自主创建基因集,可同时进行mRNA和sRNA分析、转录本结构、新基因预测等高级分析,全面解析转录组数据
优势4
除原核转录组云流程外,美吉也有转录组相关的云工具,造福广大科研人员
美吉生物云工具,涵盖数据统计,可视化绘图,个性化分析等,满足您的各种组学需求
优势5
2022年,原核转录组客户文章平均IF≥8.3
专业的售前、售后服务体系,祝您文章发表一臂之力
技术流程
基于表达矩阵,进行样本间Venn分析,获得样本间或组间的共表达和特表达基因
结果展示
应用领域
样本要求
注:详细取样指导,请联系我司技术人员
案例分析
综合化学和组学分析揭示蜡样芽孢杆菌T6菌株对铜的吸附和耐受机制
  • Integrative chemical and omics analyses reveal copper biosorption and tolerance mechanisms of Bacillus cereus strain T6
    期刊:Journal of Hazardous Materials
    IF:13.6
    发表时间:2022
    DOI: 10.1016/j.jhazmat.2022.129002
研究结果
蜡样芽孢杆菌T6菌株对Cu表现出非凡的抗性,使菌株T6在高Cu胁迫下获得了相对稳定的细胞环境。在较低的Cu浓度下,菌株T6对Cu的吸附占主导地位,而在较高的Cu浓度下,细胞形态和表面官能团发生变化,胞内和胞外的吸附都很重要。通过生理化学、基因组学、转录组学和代谢组学的综合分析,显示了T6菌株对Cu胁迫的整体细胞反应,除Cu稳态系统外,抗氧化防御系统、脂肪酸代谢、铁代谢和反硝化途径都积极参与了Cu吸附和耐受性的分子机制。
浒苔多糖(UPP)增强解淀粉芽孢杆菌Cas02的根定殖作用
  • Ulva prolifera polysaccharide enhances the root colonisation by Bacillus amyloliquefaciensstrain Cas02
    期刊:Carbohydrate Polymers
    IF:11.2
    发表时间:2022
    DOI: 10.1016/j.carbpol.2022.120171
研究结果
浒苔多糖UPP作为细菌生物膜形成的环境信号,其葡萄糖残基用作合成生物膜基质中存在的外多糖和多γ-谷氨酸的碳源,可以促进解淀粉芽孢杆菌Cas02菌株的根定植。原核转录组研究结果表明,UPP调控菌株Cas02生物膜形成和碳水化合物代谢相关基因的表达上调,碳水化合物转运和代谢相关基因的表达显著上调,推测UPP可能作为胞外多糖基质合成的碳源。此外,UPP和Cas02联合处理促进了Cas02的定植,并改善了细菌根际群落结构。本研究为提高海藻多糖的生物防治效果提供了一条可行的途径。
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