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宏基因组生物地球化学循环分析

生物地球化学循环是地球系统科学的核心研究方向之一,对碳(C)、氮(N)、磷(P)、硫(S)及重金属等元素在地球圈层中的循环过程进行描述、示踪和预测是生物地球化学循环研究的重要内容。 美吉生物宏基因组生物地球化学循环分析流程基于宏基因组高通量测序数据,根据KEGG功能注释结果中的碳、氮、磷和硫标记基因(KEGG Ontology,KO)信息,分析微生物群落在碳固定、产甲烷、甲烷氧化、氮循环、磷循环和硫循环过程中具备的遗传潜力。
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产品简介
生物地球化学循环是地球系统科学的核心研究方向之一,对碳(C)、氮(N)、磷(P)、硫(S)及重金属等元素在地球圈层中的循环过程进行描述、示踪和预测是生物地球化学循环研究的重要内容。
美吉生物宏基因组生物地球化学循环分析流程基于宏基因组高通量测序数据,根据KEGG功能注释结果中的碳、氮、磷和硫标记基因(KEGG Ontology,KO)信息,分析微生物群落在碳固定、碳降解、产甲烷、甲烷氧化、氮循环、磷循环和硫循环过程中具备的遗传潜力。
产品优势
全国独家提供完整碳氮磷硫数据专属分析流程的公司,数据挖掘更加便捷
功能基因信息覆盖面广,涵盖531个关键的碳氮磷硫循环标记基因
提供目前文献中常用的主流分析内容,流程灵活可调,可满足客户个性化分析需求
技术流程
技术流程
美吉生物研发团队基于KEGG数据库和数百篇高分SCI文献,整理出了专门用于碳、氮、磷和硫循环功能挖掘的标记基因集;碳固定标记基因集包含 7 条功能途径,112个关键基因(KOs);碳降解标记基因集包含7大有机碳化合物,166个关键基因(KOs);产甲烷标记基因集包含3条功能途径,58个关键基因(KOs);甲烷氧化标记基因集包含 2 条功能途径,68个关键基因(KOs);氮循环标记基因集包含 8条功能途径,50个关键基因(KOs);磷循环标记基因集包含 6条功能途径,55个关键基因(KOs);硫循环标记基因集包含 3条功能途径,22个关键基因(KOs)。
部分结果展示
展现不同样本中C/N/P/S功能丰度变化
堆积柱形图
应用领域
样本要求
案例分析
甲烷有氧氧化作用显著减少全球浅海水域甲烷释放
  • 案例1:甲烷有氧氧化作用显著减少全球浅海水域甲烷释放
    期刊:Nature Communications
    IF:16.6
    作者单位:中国海洋大学
    发表时间:2022
    DOI:10.1038/s41467-022-35082-y
近岸浅水区域(0-50米)虽然只占全球海洋面积的一小部分(~3%),却是海洋甲烷向大气释放的主要场所。甲烷有氧氧化过程是海洋甲烷向大气释放前的最后一道屏障。作者调查了东海的甲烷来源和去除途径,定量分析了不同生成和消耗过程的相对重要性,并通过训练机器学习模型预测了甲烷氧化速率,估算了浅水区的甲烷总消耗量;并表明约有一半的甲烷在近岸水域通过生物作用被消耗。结果进一步阐明了近海海洋甲烷的生成和排放机制,首次定量揭示了甲烷的有氧氧化过程在控制海洋甲烷释放的重要作用。
游离氨对部分反硝化作用的影响:PD-Anammox FBBR处理成熟垃圾渗滤液的长期性能、机理和可行性
  • 案例2:游离氨对部分反硝化作用的影响:PD-Anammox FBBR处理成熟垃圾渗滤液的长期性能、机理和可行性
    期刊:Water Research
    IF:12.8
    作者单位:哈尔滨工业大学土木与环境工程学院(深圳)
    发表时间:2023
    DOI: 10.1016/j.watres.2023.120238
部分脱氮(PD)作为一种稳定有效的NO2−-N积累方法,可以显著降低运行成本,而PD/Anammox(PD/a)是一种很有前途的废水处理脱氮工艺。游离氨(FA)对硝化细菌和厌氧氨氧化细菌的生物毒性已经得到证实,而FA是否影响PD细菌是一个悬而未决的问题。本文通过对PD固定床生物膜反应器(PD-FBBR)处理合成废水和成熟垃圾渗滤液的长期运行,揭示了FA对PD细菌影响的机制。
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