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FF/FFPE空间转录组测序及分析

空间转录组是在组织原位检测全转录组基因表达的一种技术,帮助在检测基因表达水平的同时,获得基因在组织内部空间表达的位置信息
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空间转录组(Spatial transcriptomics,ST):Visium空间转录组是一种组织内全转录组基因表达的原位检测技术,在检测基因表达水平的同时,获得基因在组织内部空间表达的位置信息。相比传统转录组或单细胞转录组,空间转录组保留了组织内细胞和基因表达的空间分布信息,将基因表达与H&E染色的结果叠加在一起,不需要对组织进行消化,保持组织内部的空间结构,从而实现对组织内部不同区域细胞表达异质性的研究。目前新鲜样本(FF)和石蜡样本(FFPE)均有对应的空间转录组测序解决方案。

为什么做空间转录组


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