FF/FFPE空间转录组测序及分析

空间转录组（Spatial transcriptomics，ST）：Visium空间转录组是一种组织内全转录组基因表达的原位检测技术，在检测基因表达水平的同时，获得基因在组织内部空间表达的位置信息。相比传统转录组或单细胞转录组，空间转录组保留了组织内细胞和基因表达的空间分布信息，将基因表达与H&E染色的结果叠加在一起，不需要对组织进行消化，保持组织内部的空间结构，从而实现对组织内部不同区域细胞表达异质性的研究。目前新鲜样本（FF）和石蜡样本（FFPE）均有对应的空间转录组测序解决方案。

阿尔茨海默病是发生于老年和老年前期的神经系统疾病，主要表现为记忆障碍、失语、失用、失认、视空间能力损害、抽象思维和计算能力损害、人格和行为改变等。目前阿尔茨海默病研究的一个中心问题是淀粉样斑块与神经退行性过程的关系，尽管在阿尔茨海默氏病（AD）的淀粉样斑块周围观察到复杂的炎症样变化，但对其特征的分子变化和细胞相互作用知之甚少。

本研究对AD病程中的淀粉样蛋白沉积对周围细胞的影响进行了高分辨率的解析，这些结果清楚地表明，淀粉样蛋白沉积并非简单的“发病结果”，而是会引起一系列基因变化，这可能会参与到神经退行性疾病的发病进程之中。同时强调了淀粉样蛋白沉积在AD病程中的重要性，而非只是简单的疾病产物，对人们进一步研究该疾病的病因和病程，提供了依据。

Chen Wei-Ting,Lu Ashley,Craessaerts Katleen et al Spatial Transcriptomics and In Situ Sequencing to Study Alzheimer's Disease.[J] .Cell, 2020, 182: 976-991.e19.