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产品简介免疫组库(immune repertoire，IR)：是指在任何指定时间，某个个体的循环系统中所有功能多样性B细胞和T细胞的总和。
传统的免疫组库研究技术往往只能检测TCR和BCR一条链的序列信息，而10x Genomics单细胞免疫组库测序可以同时获取TCRα链和β链、BCR的重链和轻链的表达信息。
通过Barcode标记技术将转录组与TCR/BCR结果关联分析，可以准确对应每个T/B细胞中的免疫受体信息，广泛应用于肿瘤免疫、疫苗筛选等领域研究。
产品优势- 优势1
- 性价比高
- 单细胞VDJ+表达谱测序，单个细胞成本大大降低
- 优势2
- 更全面
- 可实现配对TCRα/β和BCR重链/轻链的全长测序及配对信息
- 优势3
- 更直观
- 展示免疫组库的克隆性、多样性、抗原特异性和细胞环境等；
- 优势4
- 可联合
- 免疫组库和基因表达联合分析多角度、更深入解析数据
技术流程测序流程
分析流程
应用领域
样本要求
案例分析人膀胱癌肿瘤内CD4 T细胞介导的抗肿瘤细胞毒作用
- IF=66.85 发表时间：2020.05 技术手段：scRNA-seq&scTCR-seq 研究方向：肿瘤免疫治疗 DOI：10.1016/j.cell.2020.05.017
研究背景
免疫治疗可激活抗肿瘤细胞介导的免疫反应，使机体产生长效且持久的应答。这一疗法提高了多种恶性肿瘤患者的生存期，改变了癌症的治疗格局。然而，许多患者仍不能从中获益，如接受单一免疫检查点抑制剂治疗的过渡性上皮细胞癌(TCC)患者的治疗响应率仅约为20%。该现象可能与肿瘤浸润的T淋巴细胞(TILs)的异质性及其导致的细胞应答和治疗效果差异相关，并且T细胞亚型在肿瘤发生发展中的作用，以及对靶向PD-1/PD-L1的免疫治疗效果的响应率仍不清楚 。
实验设计
研究结果展示
本文揭示了膀胱癌肿瘤组织中Treg细胞和细胞毒性CD4+T细胞之间的相对平衡对于抗肿瘤活性具有重要意义，去除Treg细胞可使CD4+T细胞的肿瘤杀伤能力增强。通过肿瘤组织中CD4+T细胞的基因标记可以预测肿瘤免疫治疗的临床效应。
常见问题
- 生物学重复要不要设置？
- 图谱类文章可以不做生物学重复（1个样本也可以）；临床样本（人）最起码3个生物学重复；模式生物（小鼠、大鼠）尽量做生物学重复。若样本量不足，同一处理也可以混样测序。
- PE150测序最长测序覆盖的长度不超过300bp，怎么能够覆盖约650bp的扩增片段呢？
- TCR/BCR采用酶消化的方式将V(D)J cDNA随机打断，通过控制打断不同长度，并加上测序接头PCR扩增建库，用于测序。由于随机打断这一步，下图是V(D)J测序reads在某条TCR序列上的覆盖示意图。Read1的位置相对固定，检测的是序列5’端。但由于是测序片段是来源于650bp扩增序列的随机打断，不同的reads2则是随机覆盖TCR序列远端（相对5’端）的各个位置。只要有足够的数据量，最终测序数据将覆盖全部650bp TCR的扩增序列。
