- 微生物
- DNA
- 转录与调控
- 单细胞空间组
- 蛋白与代谢
- 常规测序
产品简介微生物多样性测序（又称扩增子测序），是指利用二代/三代测序平台，对16S rDNA/18S rDNA/ITS/功能基因等特定区段的 PCR 产物进行高通量测序，突破传统方法不可培养微生物的缺点，获得土壤、水体等环境，以及人体、动物等样本中的微生物群落结构、进化关系以及微生物与宿主的相关性等信息。
产品优势
- 优势1
- 分析流程随心选
- OTU、ASV云分析流程任君选；
- 优势2
- 农-医专属云平台
- 根据农学、医学研究方向，制定专属云分析流程，分析操作更丝滑；
- 优势3
- 顶刊配色切换更便捷
- 28种顶刊配色方案一键切换，助力文章更具高级感；
- 优势4
- 数据挖掘不担忧
- 70+项分析助力数据多角度挖掘，多种参数设置任意选；
技术流程
云分析示例
Alpha多样性指数组间差异检验箱线图
应用领域解决的科学问题
解析微生物群落结构、预测微生物群落表型，环境中可用以分析“什么是丰富的菌群和优质的土壤”，医学中用以解释“什么是正常的菌群和健康的肠道”。探索微生物与环境、微生物与人体的互作共存关系。
样本要求
案例分析源自 Akkermansia muciniphila 菌的新型三肽 RKH 可预防致死性脓毒症
- 英文标题：Novel tripeptide RKH derived from Akkermansia muciniphila protects against lethal sepsis 期刊：Gut IF：24.5 发表时间：2023 项目：多样性 疾病类型：脓毒症 合作单位：南方医科大学/南方医院、珠江医院、中国科学技术大学 DOI：10.1136/gutjnl-2023-329996
主要结果：① 与非脓毒症对照组相比，脓毒症患者肠道微生物AKK的相对丰度显著降低；② 在脓毒症模型中，补充AKK活菌以及其培养上清液可显著降低脓毒症引起的死亡率；③ 代谢组学分析和无菌小鼠验证实验表明，活的AKK能够产生一种新型三肽Arg-Lys-His (RKH)；④ RKH对败血症引起的死亡和器官损伤具有保护作用，能显著降低败血症诱导的炎症细胞活化和促炎因子的过量产生；⑤ 机制研究表明，RKH可直接结合toll样受体4 (TLR4)，阻断免疫细胞中TLR4的信号转导；⑥ 最后在仔猪模型中验证了RKH对败血症诱导的全身炎症和器官损伤的预防作用。
用于胃癌的非侵入性筛查和早期预警的咽峡炎链球菌和星座链球菌的粪便特征
- 英文标题：Fecal signatures of Streptococcus anginosus and Streptococcus constellatus for non-invasive screening and early warning of gastric cancer 期刊：Gastroenterology IF：29.4 发表时间：2022 项目：多样性+qPCR 疾病类型：胃癌 合作单位：上海交通大学医学院附属仁济医院 DOI：10.1053/j.gastro.2022.02.015
主要结果：① 16S rRNA测序结果表明，与慢性胃炎（ChG）相比，胃癌患者的肿瘤组织和粪便中的 Streptococcus anginosus、Streptococcus constellatus 丰度显著增加，并通过qPCR检测验证了这一结果；② S. anginosus 或 S. constellatus 可作为胃癌前期和早期癌变的早期预警信号；③ 感染幽门螺杆菌（Hp(+)）的胃癌患者肿瘤组织中Sa和Sc丰度随Hp的增加而增加；④ 通过ROC分析，评估了粪便Sa和Sc在早期胃癌中的诊断性能（灵敏度和准确性），粪便特征组合“Sa∪Sc”的方式诊断性能较优；⑤ 通过独立队列验证，Sa∪Sc模型在不同队列的GCa早期和晚期诊断中具有强大的能力，将有望改善GCa的早期预警和筛查现状。
跨界合成菌群增强番茄对镰刀枯萎病抗病能力
- 英文标题：Cross-kingdom synthetic microbiota supports tomato suppression of Fusarium wilt disease 期刊：Nature Communications IF：16.6 发表时间：2022 项目：多样性 合作单位：中国科学院微生物研究所 DOI：10.1038/s41467-022-35452-6
主要结果：由尖孢镰刀菌番茄专化型（Fusarium oxysporum f. sp. Lycopersici，FOL）造成的番茄枯萎病是重要的土传病害，在我国番茄种植区大面积发生；根际微生物组在宿主抵御病原菌侵染，维持植物健康方面发挥着重要作用。本研究揭示了根际微生物组多样性与枯萎病发病率的显著相关性；通过开展大规模分离培养获得高覆盖度的根际微生物组资源库；并依据健康微生物组网络中的核心物种、特异富集物种、及拮抗功能物种选择菌株建立了高多样性的跨界人工合成菌群，揭示了合成菌群在原位条件下抑制番茄尖孢镰刀枯萎病的功能和作用机制。
