美吉科服网 - 美吉生物一产品商城

产品简介

真菌基因组扫描图，通过二代测序平台，获得基因组的序列信息，并利用生物信息分析技术进行序列的基因预测及功能注释。研究较多的真菌主要包括模式真菌、动植物病原真菌及工业生产用真菌等，组学水平上研究热点集中在未测序物种的结构基因组学解析、代谢与调控系统解析、致病系统解析等。

产品优势

优势1: 真菌基因组云流程交付，分析内容完备，随时随地做交互分析; 9大分析模块，28项分析内容，全面解析基因组结构、基因组基础元件和比较基因组分析

优势2: 软件、参数自定义，一键定制个性化分析结果; 一键生成高质量期刊图表，结果呈图更美观，数据挖掘更省时

优势3: 14种功能数据库注释，深入挖掘功能信息，多角度解释科学问题; 6大通用数据库，8项专用数据库，多角度挖掘基因功能信息，实现对分子机制及表型与功能的深度探索

优势4: 除便捷的真菌基因组云流程外，美吉也有上百款云工具，造福广大科研人员; 400+款云分析工具，涵盖数据统计，可视化绘图，个性化分析等，满足您的各种组学需求

技术流程

结果展示

K-mer频率分布分析统计k-mer深度及各个深度所占的比例，以此评估基因组大小，基因组的杂合度和重复度

结果展示

应用领域

样本要求

注：详细取样指导，请联系我司技术人员

案例分析

案例一Antarcticomyces pellizarae的全基因组测序揭示了一种冰结合蛋白，及罕见的次级代谢产物基因簇，为Thelebolales的系统发育提供了见解

Whole-genome sequencing of the endemic Antarctic fungus Antarctomyces pellizariae reveals an ice-binding protein, a scarce set of secondary metabolites gene clusters and provides insights on Thelebolales phylogeny
期刊：Genomics
IF：4.4
发表时间：2020
DOI： 10.1016/j.ygeno.2020.05.004

研究结果

从南极雪中分离出嗜冷真菌Antarctomyces pellizariae ，并对A. pellizariae UFMGCB 12416进行基因组测序，鉴定了一个由236个氨基酸组成的冰结合蛋白编码基因，绘制了次级代谢物基因簇，并从数百个直系同源单拷贝蛋白的比对中重建了A.pellizariae与其他Leotiomycetes的系统发育关系，加深了对微生物冰结合蛋白和嗜冷真菌基因组方面的理解。

案例二卵形孢球托霉基因组草图揭示了有助于其生物降解潜力的基因

Draft genome of Gongronella butleri reveals the genes contributing to its biodegradation potential
期刊：Journal of Genetic Engineering and Biotechnology
IF：3.5
发表时间：2022
DOI： 10.1186/s43141-022-00351-2

研究结果

卵形孢球托霉是一种具有许多工业应用的真菌，从有机堆肥中分离和纯化的卵形孢球托霉 GbKAU菌株，基因组测序组装得到44639个scaffolds，基因组大小为29.8Mb，包含11428个基因。KEGG注释将这些基因分为359个参与不同途径的组，其中14个属于参与大分子降解的酶。GO注释、SSR分析和变异分析揭示了基因组的主要分子特征。与先前测序菌株的比较分析表明，它们具有数量相当的基因和相似的酶。研究结果揭示了有助于其生物降解潜力的基因和途径。