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单细胞转录组测序及分析

从单个细胞水平对基因组和转录组进行研究,通过全基因组或转录组扩增,进行高通量测序,揭示单个细胞的基因结构和基因表达状态,反映细胞间的异质性
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产品简介
单细胞转录组测序(scRNA-seq),是指在单细胞水平上对 RNA 进行高通量测序和分析的新技术,具有通量高、成本低的显著优势。 不同于常规组织或细胞群测序得到的结果,scRNA-seq单细胞测序能够表征单个细胞的表达谱,避免单个细胞的异质性生物学信息被大量细胞的均质化掩盖,从而更好地理解细胞之间的差异和功能。
产品优势
采用行业成熟、前沿的10x单细胞技术平台
精细检测上万个单细胞的基因表达图谱
方便快捷,10分钟内可完成上万细胞的捕获
可适性高,适合大部分细胞类型
技术流程
测序流程
分析流程
应用领域
样本要求
案例分析
两侧椎旁肌肌肉干细胞ESR1信号通路不对称在青少年特发性脊柱侧凸发生发展中的作用
  • 期刊:Cell Discovery
    IF=38.07
    发表时间:2023.04
    技术手段:scRNA-seq
    研究方向:疾病发生发展
    DOI:10.1038/s41421-023-00531-5
研究背景
青少年特发性脊柱侧凸(AIS)是发生于青春期病因未明的复杂三维脊柱畸形,在青少年中的发病率可达2%-3%。患有AIS的女性比例高得不成比例(女性/男性比例为3:1),女性患者也往往具有更高的弯曲弧度。严重弯曲的患者甚至可能遭受心肺功能障碍和其他健康问题。尽管遗传、环境、神经肌肉和激素因素都与AIS有关,但AIS发生和发展的机制仍有待阐明。
实验设计
研究结果展示
该研究发现ESR1(Estrogen Receptor 1)在AIS患者凹侧肌肉干细胞/祖细胞中的表达下降,并且ESR1是肌肉干细胞/祖细胞分化所必需的,ESR1信号的中断会导致分化缺陷。此外,研究人员通过抑制椎旁肌肉一侧的ESR1活性来建立脊柱侧弯小鼠模型,结果发现椎旁肌肉中ESR1信号的不平衡可诱导小鼠脊柱侧弯,而FDA批准的药物雷洛昔芬(Raloxifene)在凹侧重新激活ESR1信号可极大地缓解弯曲进展。这是近年来AIS病因学机制研究领域的重要突破之一。
常见问题
生物学重复要不要设置?
图谱类文章可以不做生物学重复(1个样本也可以);临床样本(人)最起码3个生物学重复;模式生物(小鼠、大鼠)尽量做生物学重复。若样本量不足,同一处理也可以混样测序。
什么情况下可以混样?
取材量少时,需要样本混合才能得到足够的细胞数;能够通过外源细胞Barcode标记不同来源的细胞,此时可以做混样操作,此种方法可以在样本混合的基础上做样本间细胞构成差异分析。
单细胞测序还是单细胞核测序
细胞直径较大(如脂肪、肌肉、神经元),细胞敏感(肝细胞、肾小球细胞);无法获得新鲜组织的情况建议选择抽核。
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