单细胞ATAC

单细胞ATAC（scATAC，Assay for Transposase-Accessible Chromatin with high-throughput sequencing，染色质易开放区测序）：在单个细胞水平上测量染色质的开放性，从而揭示细胞之间的异质性以及基因调控网络的动态变化。 通过对单个细胞中基因座（转录开合区域、启动子、增强子等）的开放性状态研究，有助于揭示细胞类型、亚群、细胞分化过程以及细胞在不同环境中的反应。 这项技术在研究转录因子结合、染色质状态以及基因调控网络中的动态变化方面具有重要意义。

调节性 T (Treg) 细胞发挥各种关键功能。特别是，它们抑制自身反应和过度炎症，从而促进免疫调节，它们还可以促进组织损伤后的组织稳态和再生。尽管小鼠组织修复Treg细胞已经得到很好的证实，并且在单细胞水平上描述了它们的发育，但对人类修复Treg程序知之甚少。

通过10x Genomics单细胞ATAC-seq检测了小鼠和人类组织中的CD4+T细胞，并定义了一个共享的组织修复Treg特征。利用这一特征和TCR追踪识别了外周血中人类BATF+CCR8+组织样Treg细胞，并揭示了组织中这一群体的T-follicular helper(Tfh)样分化程序。在幼稚的Treg细胞中诱导Tfh程序可以促进组织表型，包括修复功能。将健康组织中的CCR8+Treg细胞与从肿瘤组织中分离出来的CCR8+Treg细胞进行比较，发现了许多相似之处。