美吉生物

生物培训班 培训班详情
课程介绍 课程表

主办单位:上海美吉生物医药科技有限公司

承办单位:美吉科技研究院

开课时间:2019年暑期(7-8月份)



培训专题一 微生物方向生信培训班计划(课程表附后)


期数

开班地点

培训班主题

开班时间

开班时长

价格

89

杨凌

微生物多样性数据分析速成班

712-14日(周五-周日

3

3000/

90

上海

比较基因组学精品班

715-19日(周一-周五

5

5000/

92

上海

微生物多样性生信培训精品班

722-26日(周一-周五

5

5000/

94

上海

科研绘图班

727-28日(周六-周天)

2

2000/

95

上海

宏基因组学精品班

85-8日(周一-周四

4

5000/

100

上海

科研绘图班

817-18日(周六-周日

2

2000/

101

武汉

微生物多样性数据分析速成班

819-21日(周一-周三

3

3000/

102

上海

微生物多样性生信培训精品班(纯生信)

819-22日(周一-周四

4

5000/

103

昆明

宏基因组学速成班

823-25日(周五-周日

3

3000/

105

上海

微生物基因组+转录组培训班

826-30日(周一-周五

5

5000/

107

郑州

微生物多样性数据分析速成班

830-91日(周五-周日

3

3000/


培训专题二 真核生物方向生信培训班计划(课程表附后)


期数

开班地点

培训班主题

开班时间

开班时长

价格

90

上海

比较基因组学精品班

715-19日(周一-周五)

5

5000/

91

上海

转录组学生信培训精品班

722-26日(周一-周五)

5

5000/

93

上海

科研绘图班

727-28日(周六-周天)

2

2000/

94

上海

蛋白质组学精品班

729-81日(周一-周四)

4

4500/

96

上海

代谢组学数据分析速成班

89-11日(周五-周日)

3

3500/

97

上海

转录组学生信培训精品班

812-16日(周一周五)

5

5000/

98

南宁

蛋白组学+代谢组学速成班

816-18日(周五-周日)

3

3000/

99

杭州

转录组学数据分析速成班

816-18日(周五-周日)

3

3000/

100

上海

科研绘图班

817-18日(周六-周日)

2

2000/

104

呼和浩特

转录组学数据分析速成班

823-25日(周五-周日)

3

3000/

其他城市如有培训需求,人数在10人以上,可与下方李老师联系。

 

招生人数:30/


培训特色:

理论+上机,手把手教会生信分析; 

11指导,2-3名助教重点辅导; 

培训班学员享有无限期免费在线售后服务; 

培训班学员优先获得上海张江生物医学联盟实习/工作机会; 

丰富课后活动,方便学员间交流; 

参观高标准实验室,近距离接触高通量测序技术(按实际情况安排)


收费标准:

1、各期培训班费用详见上表。

2、培训费包含学费、资料费、食宿自理;

3、上海培训班(上海2天科研绘图班除外)的报名费包含课程费+午餐费+一张迪士尼门票(全天);

4、上海班可统一协助预定酒店,费用自理;

5取消报名至少提前2个工作日通知,培训费可全款退还;2个工作日内的,只可调班不可退款。

 

优惠政策:

1美吉测序分析客户尊享生信培训班VIP抵用券(发送到合同邮箱),面额500-1500元不等,有效期14天,请尽快使用。

2团报优惠。3人及以上报同一班次,每人减免200

3多班连报优惠。同一个人报两个及以上班次,从第二班次开始,每个班次减免500

4以上各种优惠不叠加使用

5上海班(2天科研绘图班除外)可同时享受团报+迪士尼门票或多班连报+迪士尼门票。

 

开票类型培训费、技术服务费、生信分析费、数据分析费会议费


报名方式:

方式一 扫码报名:扫描下方二维码填写基本信息

真核生物方向培训课程报名    微生物方向培训课程报名

 

方式二 联系当地销售人员报名

方式三 联系美吉生物总部

王老师  021-31050579

李老师  166-2105-5149

微信 Majorbio_YJY

邮箱 scholar@majorbio.com


专题一课程表 微生物方向


微生物多样性生信培训精品班(上海)

日程

主题

课程内容

课时

第一天

上午

走进微生态研究

1.微生态技术在环境、人体和动物等不同研究领域中的前沿进展;

2.微生态研究不同组学技术介绍;

3.微生态不同领域的研究思路、经典案例介绍等;

4.微生态不同领域的方案设计、取样方法介绍等。

3 h

下午

微生物多样性

基础分析流程实战

1.常用分析软件及数据库介绍;

2.序列质控;

3.OTU聚类与物种分类;

4.α多样性等分析。

4 h

第二天

上午

微生物多样性数据挖掘实战(一)

1.数据管理模块;

2.物种注释与评估模块;

3.物种组成分析模块

3 h

下午

微生物多样性数据挖掘实战(二)

4.样本比较分析模块;

5.物种差异分析模块;

6.环境因子关联分析模块

4 h

第三天

上午

微生物多样性数据挖掘实战(三)

7.关联与模型预测分析模块;

8.进化分析模块;

9.16S功能预测分析模块;

10.MicroPITA分析模块。

3 h

下午

R语言数据处理与绘图(

1.R语言和R软件简介;

2.数据类型和基础语法简介;

3.常用数据操作方法介绍和练习;

4.R基础绘图命令和绘图参数使用介绍和练习。

4 h

第四天

上午

R语言数据处理与绘图(

1.物组组成分析:Venn图、群落Bar/Pie图等

2.样本比较分析:层次聚类树、PCA/PCoA/NMDS

3 h

下午

R语言回顾、答疑

1h

个性化分析与绘图

利用STAMP软件进行差异比较分析

1.5 h

网络图绘制软件Cytoscape使用介绍和实操。

1.5 h

第五天

上午

图片编辑

图片编辑软件Adobe Illustrator使用介绍和实操。

1.5 h

数据上传

原始数据上传NCBI流程介绍和实操。

1.5 h

下午

课程回顾与答疑

全体讲师参与,课程回顾、交流、答疑

3 h


参观实验室。


微生物多样性数据分析速成班(杨凌/武汉/郑州)

日程

主题

课程内容

课时

第一天

上午

走进微生态研究

1.微生态技术在环境、人体和动植物等不同研究领域中的前沿进展;

2.微生态研究不同组学技术介绍;

3.微生态不同领域的研究思路、经典案例介绍等;

4.微生态不同领域的方案设计、取样方法介绍等。

3h


下午

多样性标准分析与数据挖掘:理论+实战(一)

1.数据管理模块;

2.物种注释与评估模块;

3.物种组成分析模块;

4h

第二天

上午

多样性高级分析与数据挖掘:理论+实战(二)

4.样本比较分析模块;

5.物种差异分析模块。

3h


下午

多样性高级分析与数据挖掘:理论+实战

6.环境因子关联分析模块;

7.关联与模型预测分析模块;

8.进化分析模块;

9.16S功能预测分析模块;

10.MicroPITA分析模块。

4h

第三天

上午

个性化分析与绘图(

利用STAMP软件进行两个样本差异比较分析、两组样本差异比较分析和多组样本差异比较分析的使用介绍和实操。

1.5h



个性化分析与绘图(

网络图绘制软件Cytoscape使用介绍和实操。

1.5h


下午

个性化分析与绘图(

AI软件功能介绍和常规操作演练。

1.5h



课程回顾与答疑

全体讲师参与,课程回顾、交流、答疑

2h


                微生物多样性生信培训精品班(纯生信,上海)

日程

主题

课程内容

课时

第一天

上午

走进微生态研究

1.微生态技术在环境、人体和动物等不同研究领域中的前沿进展;

2.微生态研究不同组学技术介绍;

3.微生态不同领域的研究思路、经典案例介绍等;

4.微生态不同领域的方案设计、取样方法介绍等。

2 h

 

Linux基础操作 (一)

1、Linux介绍;

2、文件和目录的创建、移动、复制、查找、权限修改等实操

1h

下午

Linux基础操作 (二)

1. 文件的编辑、查看、排序、合并、修改等命令实战

2. 命令行对批量文件的筛选、合并和替换

4 h

第二天

上午

Linux多样性

基础分析流程 (一)

1. FASTQ、BAM和BIOM等常用多样性数据格式介绍与实操

2. NCBI、Silva和Greengene等常用多样性数据库介绍与实操;

3. 生信数据格式转换软件介绍与实操

4. Mothur、QIMME和FLASH等多样性分析软件介绍与实操。

3 h

下午

Linux多样性

基础分析流程 (二)

1. 测序数据清洗流程(过滤、拼接等)介绍与实操

2. OTU划分、聚类及注释实操

2. Mothur多样性指数及物种分布分析

4 h

第三天

上午

R语言基础语法

1. R语言和R软件介绍与安装

2. 数据类型和语法介绍与实操。

3 h

下午

R语言数据处理

1. 利用R语言对OTU丰度表进行处理并获取统计性绘图数据;

2. R语言统计学分析:pearson、t-test和mantel test等

4 h

第四天

上午

R语言物种组成绘图

1. R基础绘图命令和参数介绍;

2. 物种组成图绘制:Venn、Bar、Pie 和 Heatmap图

3 h

下午

R语言样本比较绘图

样本比较分析图形绘制及参数调整:PCA、NMDS 和 PCoA图

2h

课程答疑、参观实验室。

2 h


                     宏基因组学生信培训精品班(上海)

日程

主题

课程内容

课时

第一天

上午

走进微生态研究

1.微生态技术在环境、人体和动植物等不同研究领域中的前沿进展;

2.微生态研究不同组学技术介绍;

3.微生态不同领域的研究思路、经典案例介绍等;

4.微生态不同领域的方案设计、取样方法介绍等。

3 h

下午

宏基因组数据处理流程

宏基因组下机数据处理流程介绍和实战演练;

1.数据清洗;

2.序列组装;

3.基因预测;

4. 非冗余基因集构建。

4 h

第二天

上午

宏基因组数据挖掘实战(一)

1.数据信息管理模块;

2.测序序列统计与质控分析模块;

3.序列组装和基因预测分析模块;

4.基因集构建与丰度计算分析模块;

5.物种与功能注释分析模块;

3 h

下午

宏基因组数据挖掘实战(二)

6.个性化功能注释

7.物种与功能组成分析模块;

8.物种与功能比较分析模块;

4 h

第三天

上午

宏基因组数据挖掘实战(

9.物种与功能差异分析模块;

10.环境因子关联分析模块;

11.关联与模型预测分析模块。

3 h

R语言绘图

1.R语言和R软件简介;

2.物组组成分析:Venn图、群落Bar/Pie图、Heatmap图等;

3.样本比较分析:层次聚类树、PCA/PCoA/NMDS等分析原理、结果释义和利用R语言进行数据处理和图形绘制。

4 h

第四天

图片编辑

图片编辑软件Adobe Illustrator使用介绍和实操。

文字编辑、图形编辑、图形排版。

1.5 h

数据上传

原始数据上传NCBI流程介绍和实操。

1.5 h

下午

回顾与答疑

全体讲师参与,课程回顾、交流、答疑

3 h

参观实验室。


                      宏基因组学生信培训速成班(昆明)

日程

主题

课程内容

课时

第一天

上午

走进微生态研究

1.微生态技术在环境、人体和动植物等不同研究领域中的前沿进展;

2.微生态研究不同组学技术介绍;

3.微生态不同领域的研究思路、经典案例介绍等;

4.微生态不同领域的方案设计、取样方法介绍等。

3 h

下午

宏基因组数据挖掘实战(一)

1.数据信息管理模块;

2.测序序列统计与质控分析模块;

3.序列组装和基因预测分析模块;

4.基因集构建与丰度计算分析模块;

5.物种与功能注释分析模块;

4 h

第二天

上午

宏基因组数据挖掘实战(二)

6.个性化功能注释

7.物种与功能组成分析模块;

8.物种与功能比较分析模块;

3 h

下午

宏基因组数据挖掘实战(三)

9.物种与功能差异分析模块;

10.环境因子关联分析模块;

11.关联与模型预测分析模块。

4 h

第四天

个性化分析与绘图(一)

STAMP软件使用介绍和实操。

1.5 h

个性化分析与绘图(二)

网络图绘制软件Cytoscape使用介绍和实操。

1.5 h

下午

个性化分析与绘图(三)

AI软件功能介绍和常规操作演练。

1.5 h

课程回顾与答疑

全体讲师参与,课程回顾、交流、答疑

2h


                     微生物基因组学+转录组学培训精品班(上海)

日程

主题

课程内容

课时

第一天

上午

生物信息学概述及高通量测序原理

(1)生物信息学知识背景概述

(2)高通量测序技术的行业概况、发展历程、应用方向、测序原理

3 h

下午

高通量测序技术在微生物领域的应用

(1)微生物组学研究的方法

(2)生物信息学层面的微生物组数据挖掘和经典文章设计思路、科学问题解决方案分享

(3)高通量测序技术与微生物产业

1.5h

Linux操作基础入门与实操练习

(1)Linux系统搭建、常用命令介绍

(2)Linux系统软件安装

(3)实操练习

2.5h

第二天

上午

测序数据质控和常用数据格式介绍

(1)二代测序结果的质控流程和质控标准

(2)常用数据格式包括FASTQ、FASTA、SAM、BAM、gff、gbk等

3 h

下午

二代测序的数据组装和基因预测

(1)基于二代测序结果的基因组组装

(2)基因组中gap产生的原因和补gap的方法

(3)基因的预测方法

4 h

第三天

上午

基因组注释

(1)基础注释:nr注释、ncRNA注释、重复序列注释

(2)KEGG注释

(3)水平转移元件注释

3 h

下午

比较基因组分析

(1)Local BLAST使用

(2)同源基因分析

(3)比较基因组圈图绘制

2.5 h

数据上传NCBI操作

(1)gbk文件的生成

(2)原始数据上传NCBI

(3)基因组注释数据上传NCBI

1.5 h

第四天

上午

转录组生产流程与数据质控

(1)链特异性转录组与普通转录组的区别与联系

(2)转录组的建库与质检流程

(3)测序结果的随机性、饱和度、覆盖度分析

3 h

下午

链特异性转录组生信分析流程实操

(1)转录组的数据质控与比对分析

(2)表达差异基因的分析

(3)小RNA预测软件以及靶基因预测

4 h

第五天

上午

细菌基因组云平台交互分析与数据挖掘

1)细菌基因组数据分析逻辑

2)十大模块37项分析介绍

(3)在线操作数据挖掘

(4)结果解读

1.5 h

下午

课程回顾与答疑

全体讲师参与,课程回顾、交流、答疑

3 h

参观实验室。


                 比较基因组学信息挖掘精品班(上海)

天数

时间

主题

内容

时长

第一天

上午

比较基因组
研究介绍

1.比较基因组内容介绍
2.比较基因组研究现状
3.比较基因组分析维度

3h

下午

Linux和R
基础操作学习

1.基于比较基因组的Linux基础操作
2.比较基因组Linux软件安装
3.基于比较基因组的R基础操作

4h

第二天

上午

基因组组装和注释

1. 基于高通量测序数据的基因组组装
2.基因预测方法实操

3.常见的基因功能注释

3.5h

下午

比较基因组方案
设计和数据选择

1.参考基因组数据的选择依据
2.比较基因组分析方案设计

1.5h

比较基因组
数据准备

1.参考基因组筛选实操
2.参考数据查询及下载实操

2.5h

第三天

上午

目标序列比较及
可视化展示(一)

1.共线性分析及比较基因组圈图介绍2.MCscan共线性分析

3h

下午

目标序列比较及
可视化展示(二)

 Circos绘制比较基因组圈图

1.5h

基于相似度
提取目标基因

1.直系和旁系同源基因分析原理
2.Blast获取同源基因
3. OrthoMCL获取同源基因

2.5h

第四天

上午

物种进化之(一)
进化树构建

1.进化树在基因组比较中的应用
2.MuscleRAxML直系同源基因进化树构建
3.物种进化树科研绘图要求及图形优化

3h

下午

物种进化之(二)
基因家族分析

1.基因家族分析原理及应用
2. r8sCAFE分析家族扩张和收缩

4h

晚上

实操和答疑

1.5h

第五天

上午

物种进化之(三)
选择进化分析

1.分歧时间及选择压力分析介绍
2.MCMCTree物种分歧时间
3. GlocksCodeML分析正选择基因

3h

下午

比较基因组
文章解读

1.高分文章比较基因组应用领域 
2.文献中比较基因组分析逻辑

2.5h

培训课程回顾和答疑

1.5h


                                科研绘图班(上海)

日程

主题

课程内容

课时

第一天

上午

科研论文图片规范

1、国际期刊投稿对图片的基本要求:插图格式、分辨率、字体、色彩等

2、常见插图类型:数据类型图片、实验类型图片、复合类型图片、特殊类型图片;

3、插图制作流程;

4、SCI论文中插图常见问题和解决方案。

1.5h

初识Photoshop

1、Photoshop软件功能介绍和常用操作

2、Photoshop软件常用功能学与练:剪裁、尺寸、色彩调整、字体、图层。

1.5h

 

下午

Photoshop修图实战

1、Photoshop软件高级功能:污点修复、抠图、形状/文字标注、照片细节放大、图片排版;

2、使用Photoshop完成对SCI论文图片加工实操学习;

3、课程回顾与答疑

4h

第二天

上午

Adobe Ilustrator软件

常用操作

1、AI软件功能介绍和常规操作演练:拼排、添加文字、画线、绘图、提取图像元素

2、AI案例实训:各类文字处理。

3h

下午

Adobe Ilustrator修图与绘图实战

1、以heatmap图处理为例:元素对齐、颜色变换、坐标轴变更、图例生成与变更

2、以组分分布图为例:图片组合、填充变换、页面排布;

3、代谢通路图绘制:箭头、路径文字、钢笔绘图、图形工具、过度颜色;

4、扩展学练:细胞模型绘制;

5、课程回顾、交流和学员的实际问题解答,满足投稿要求。

4h


                           转录组学生信培训精品班(上海)

日程

主题

课程内容

课时

第一天

上午

转录组学研究概要

1. 转录组学在动物、植物以及医学等研究领域的前沿进展;

2. RNA分类、作用机制与应用领域介绍;

3. 转录调控测序原理及生信分析内容介绍;

4. 转录调控在不同领域的研究思路、经典案例解析等;

5. 转录调控在不同领域的方案设计、取样方法介绍等。

3 h

下午

Linux 操作系统入门和实操

练习常用命令的基本使用及实战技巧

1. 文件、目录的创建、移动、复制、删除、查找、权限修改等命令;

2. 文件的编辑、查看、排序、合并、修改等命令。

4 h

第二天

上午

R语言绘图入门实操(一)

1. R语言数据处理及基础绘图介绍;

2. R语言数据结构常用数据处理方法

3 h

下午

R语言绘图入门实操(二)

1.ggplot2作图实战;

2 转录组高级作图实战(绘制散点图,热图,饼图,venn图)。

4 h

第三天

上午

转录组分析流程实操(一)

1.转录组数据格式介绍及数据在线获取;

2.转录组数据质控;

3.转录本序列的获得

3 h

下午

转录组分析流程实操(二)

3. 表达定量和样本间相关性分析

4. 表达量差异分析

4 h

第四天

上午

转录组分析软件实操(三)

5.差异基因注释和富集分析

6.可变剪切分析

7.高级分析软件STEM)介绍与实战

3 h

下午

转录组分析软件实操(四)

8. 高级分析软件(WGCNA)介绍与实战;

9. 转录因子预测与靶基因预测

4 h

上午

真核转录组分析思路与数据挖掘

1. 真核转录组十大标准分析介绍与交互练习;

2. 基于表达量的数据挖掘思路与实操;

3. 基于基因功能、序列结构等的数据挖掘思路与实操。

4. 文章案例实战(使用真核转录组云平台,重现已发表文章分析内容,手把手教你用云平台做文章)。

3 h

下午

NCBI 数据上传

原始数据上传 NCBI SRA数据库流程介绍与实操 。

1h

课程答疑

课程答疑、常见数据分析问题、产生原因及解决方案;

2h

参观实验室

1 h


                      转录组生信培训速成班(杭州,呼和浩特)

日程

主题

课程内容

课时

 第一天

上午

转录组学研究概要

1. 转录组学在动物、植物以及医学等研究领域的前沿进展;

2. RNA分类、作用机制与应用领域介绍;

3. 转录调控测序原理及生信分析内容介绍;

4. 转录调控在不同领域的研究思路、经典案例解析等;

5. 转录调控在不同领域的方案设计、取样方法介绍等。

3h

下午

真核转录组
标准分析与数据挖掘(一)

1. 真核转录组十大标准分析介绍与交互练习;

2. 基于表达量的数据挖掘思路与实操;

3. 基于基因功能、序列结构等的数据挖掘思路与实操。

4h

第二天

上午

真核转录组
高阶分析与数据挖掘(二)

4. 真核转录组常见高阶分析原理与应用(WGCNA分析、转录因子分析、蛋白互作网络分析等);

5. 文章案例实战(使用真核转录组云平台,重现已发表文章分析内容,手把手教你用云平台做文章)。

3h

下午

常用数据库介绍、
在线分析实操

1. 常用数据库介绍(包括 NCBI、ENSEMBL、GO、KEGG、STRING、PlantTFDB、AnimalTFDB等);

2. 各数据库常用在线分析功能实操演练。

2.5h

个性化绘图与实战(一)

网络图绘制软件Cytoscape使用介绍和实操。

1.5h

第三天

上午

个性化绘图与实战(二)

AI软件功能介绍和常规操作演练。

1.5h

NCBI数据上传

原始数据上传NCBI SRA数据库流程介绍与实操。

1.5h

下午

课程答疑

1.转录组研究中常见的数据分析问题、产生原因及解决方案;
2.课程回顾与答疑。

3h


                       蛋白质组学精品班(上海)

日程

主题

课程内容

课时

第一天

上午

蛋白组学研究概述

1、质谱技术介绍;

2、蛋白组学基本概述;

3、iTRAQ、TMT、labelfree、PRM等常用技术原理介绍。

1.5h

蛋白质组学实验设计及实验过程

1、样品准备方法及注意事项;

2、样品制备流程及常见问题;

3、实验流程介绍;

4、实验方案设计及经典案例分享。

1.5h

下午

Linux 操作系统入门和实操

练习常用命令的基本使用及实战技巧

1. 文件、目录的创建、移动、复制、删除、查找、权限修改等命令;

2. 文件的编辑、查看、排序、合并、修改等命令。

1.5h

R语言数据处理与绘图

1、R简介与R包安装;

2、R语言数据类型与结构;

3、常用基础语法;

4、常用数据处理方法;

5、R语言常用绘图命令、绘图参数使用实战。

2.5h

第二天

上午

蛋白质组学数据分析应用(上机)

1、根据蛋白ID提取蛋白序列;

2、local blast实战;

3、使用KAAS进行KEGG注释。

3 h

下午

R语言数据处理与绘图

1、R语言绘制聚类热图;

2、R语言绘制火山图;

3、R语言绘制聚类富集柱状图及气泡图。

4 h

第三天

上午

常用数据库介绍

包括NCBI、Uniprot、GO、KEGG、STRING、DAVID等

数据库的介绍及使用方法。

3 h

基于i-sanger 云平台深入挖掘蛋白组学数据;

 

1、 差异蛋白统计与计算;

2、 蛋白KEGG注释与GO注释;

3、 蛋白集KEGGGO富集分析

4、 蛋白集相互作用分析

5、 Ipath分析

4 h

第四天

蛋白组学数据挖掘及文章思路

1、文章写作相关套路介绍;

2、原始数据上传讲解

3 h

下午

回顾与答疑

全体讲师参与,课程回顾、交流、答疑

3 h

参观实验室。


                               代谢组学培训班(上海)

日程

主题

课程内容

课时

第一天

上午

代谢组学研究概述

1、非靶代谢与靶向代谢的实验原理与介绍;
2、代谢组学实验及分析流程介绍;
3、各类样品准备方法及注意事项;
4、各类样品抽提方法及注意事项;
5、不同研究方向实验方案设计。

3h

下午

代谢组学数据处理实战

1、代谢组数据处理一般流程介绍;
2、多元统计方法原理及操作介绍;
3、常用统计软件SIMCA介绍;
4、常用PCAPLS-DAoPLS-DA分析原理及结果解读;
5PCAPLS-DAoPLS-DA分析实战。

4h

第二天

上午

3h

下午

代谢组学数据分析与挖掘实战

1、表达量数据预处理;
2、样本相关性热图分析;
3、样本间相关性分析(PCA);
4、代谢化合物分类分析;
5、功能通路分析(KEGG);
6、差异代谢物计算与统计;
7、代谢物聚类分析;
8、代谢物相关性分析;
9、代谢物通路富集;
10、iPath分析;
11、关联分析—相关性热图;
12、关联分析—普氏分析。

4h

第三天

上午

数据分析及文章写作思路

1、经典案例解读;
2、代谢组研究整体思路流程;
3、常见文章写作思路介绍。

3h

下午

课程回顾

整体回顾答疑,参观实验室

3h


                    蛋白与代谢数据分析速成班(南宁)

日程

主题

课程内容

课时

第一天

上午

蛋白组学研究概述

1、质谱技术介绍;

2、蛋白组学基本概述;

3、iTRAQ、TMT、labelfree、PRM等常用技术原理介绍。

1.5h

蛋白质组学实验设计及流程

1、样品准备方法及注意事项;

2、样品制备流程及常见问题;

3、实验流程介绍;

4、实验方案设计及经典案例分享。

1.5h

下午

蛋白质组学分析实战

1、 差异蛋白统计与计算;

2、 蛋白KEGG注释与GO注释;

3、 蛋白集KEGGGO富集分析

4、 蛋白集相互作用分析

5Ipath分析

4h

第二天

上午

R语言数据处理与绘图(一)

1、R简介与R包安装;

2、R语言数据类型与结构;

3、常用基础语法;

4、常用数据处理方法;

5、R语言常用绘图命令、绘图参数使用实战。

3 h

下午

R语言数据处理与绘图(二)

1、利用R语言进行数据处理;

2、统计检验;

3、常用绘图包介绍与实战(ggplot2、igraph等)。

4 h

第三天

上午

代谢组学研究概述

1、非靶代谢与靶向代谢的实验原理与介绍;
2、代谢组学实验及分析流程介绍;

3、常用PCAPLS-DAoPLS-DA分析原理及结果解读。

3 h

代谢组学数据分析

PCAPLS-DAoPLS-DA分析实战

1 h

1、代谢化合物分类分析;
2、功能通路分析(KEGG);
3、差异代谢物计算与统计;

4、代谢物聚类分析;
5、代谢物相关性分析;
6、代谢物通路富集;
7、iPath分析;
8、关联分析—相关性热图;
9、关联分析—普氏分析。

2h

回顾与答疑

全体讲师参与,课程回顾、交流、答疑

1h


                    转录组+代谢组学培训班(武汉)

日程

主题

课程内容

课时

第一天

上午

转录组学研究概要

1. 转录组学在动物、植物以及医学等研究领域的前沿进展;

2. RNA分类、作用机制与应用领域介绍;

3. 转录调控测序原理及生信分析内容介绍;

4. 转录调控在不同领域的研究思路、经典案例解析等;

5. 转录调控在不同领域的方案设计、取样方法介绍等。

3 h

下午

常用数据库介绍、在线分析实操

1. 常用数据库介绍(包括 NCBI、ENSEMBL、GO、KEGG、STRING、PlantTFDB、AnimalTFDB 等);

2. 各数据库常用在线分析功能实操演练。

4 h

第二天

上午

真核转录组

标准分析与数据挖掘(一)

1. 真核转录组十大标准分析介绍与交互练习;

2. 基于表达量的数据挖掘思路与实操;

3. 基于基因功能、序列结构等的数据挖掘思路与实操

3 h

下午

真核转录组

高阶分析与数据挖掘(二)

4. 真核转录组常见高阶分析原理与应用(WGCNA 分析、转录因子分析、蛋白互作网络分析等);

5. 文章案例实战(使用真核转录组云平台,重现已发表文章分析内容,手把手教你用云平台做文章)。

4 h

第三天

上午

代谢组学

研究概要和文章思路

1、非靶代谢与靶向代谢的实验原理;

2、方案设计与经典案例分享;

3、研究前沿。

3 h

下午

代谢组学数据

处理方法介绍与实操

1、常用统计软件SIMCA介绍;
2、常用PCA、PLS-DA、oPLS-DA分析原理及结果解读;
3、PCA、PLS-DA、oPLS-DA分析实战。

4 h

第四天

代谢组学数据

深度挖掘实操

1、表达量数据预处理;

2、样本相关性热图分析;

3、样本间相关性分析(PCA);

4、代谢化合物分类分析;

5、功能通路分析(KEGG);

6、差异代谢物计算与统计;

7、代谢物聚类分析;

8、代谢物相关性分析;

9、代谢物通路富集;

10、iPath分析;

11、关联分析—相关性热图;

12、关联分析—普氏分析。

3 h

数据上传

原始数据上传NCBI流程介绍和实操

1.5h

回顾与答疑

课程回顾、交流、答疑

2.5h


2019年美吉暑期生信培训班震撼来袭,全国多地同时开办!

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