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靶向蛋白质组学

靶向蛋白质组学,是在蛋白质组学的基础上发展而来的专门针对特定的目标蛋白质进行定量研究的一门科学。相比于非靶向蛋白质组学,靶向蛋白质组学有针对性的选择离子进行质谱数据采集,因此可以用于大量样本的分析且具有更好的准确性、灵敏度和重现性。
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产品简介
平行反应监测(Parallel Reaction Monitoring, PRM)是一种基于高分辨、高精度质谱的离子监视技术,能够对目标蛋白质、目标肽段(如发生翻译后修饰的肽段)进行选择性检测,从而实现对目标蛋白质/肽段进行相对/绝对定量。PRM技术基于Q-Orbitrap 为代表的高分辨、高精度质谱平台,首先利用四级杆质量分析器的选择能力,用Q1选择目标肽段的母离子,随后在collision cell 中对母离子进行碎裂, 最后利用Orbitrap 分析器在二级质谱中检测所选择的母离子窗口内的所有碎片信息。这样即可对复杂样本中的目标蛋白质/肽段进行准确地特异性分析。
产品优势
PRM vs Western
优势1
不依赖抗体检测
无需抗体,获取更加准确和重现性高的蛋白定量结果
优势2
满足多种定量需求
PRM既可以做蛋白的绝对定量,也可以做蛋白的相对定量
优势3
灵敏度更高
质量精度达到ppm级,更好的排除背景干扰和假阳性,有效提高复杂背景下的检测限和灵敏度
优势4
高通量检测
PRM技术通量高,每个工作循环能处理300对母离子-子离子对,可同时研究多种蛋白质的修饰和丰度
技术流程
应用领域
样本要求
案例分析
基于iTRAQ和PRM的低镉条件下水稻根质膜蛋白在锌胁迫响应中的潜在作用
  • 英文题目:The potential role of plasma membrane proteins in response to Zn stress in rice roots based on iTRAQ and PRM under low Cd condition 期刊:Journal of hazardous materials IF=13.6 发表时间:2022.01 项目: iTRAQ蛋白组、PRM蛋白组 研究方向:水稻根质膜蛋白 DOI:10.1016/j.jhazmat.2022.128324
研究背景
镉污染已经对作物生长发育、食品安全和人类健康造成严重威胁,并成为潜在的农业和全球环境问题。锌被用来减少土壤和植物中镉的积累。位于质膜上的蛋白质在植物逆境信号传递中起着重要作用。为了进一步阐明PM蛋白如何在低镉条件下调节锌/镉的转运,采用定量蛋白质组学方法在蛋白质组水平上鉴定和验证差异表达蛋白及其生物学功能。
技术路线
重要结论
作者通过PRM蛋白质组学分析验证iTRAQ蛋白质组学结果发现的7个具有潜在离子转运功能的候选蛋白。进行PRM可行性分析发现只有4个蛋白适合进行PRM验证。在iTRAQ和PRM中只有蛋白A0A1B1ELU7在不同处理中的表达变化相同,且始终下调。可作为水稻根系重金属胁迫响应蛋白生物标志物,同时为水稻根系抗重金属胁迫解毒机制的研究提供了参考
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