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蛋白质组学和代谢组学 修饰蛋白质组学 定量修饰蛋白质组分析

定量修饰蛋白质组分析 生信分析 技术参数 案例解读 留言咨询

       蛋白质组学的研究的工作不仅聚焦于细胞不同生长时期或是疾病条件下的蛋白质表达水平变化,许多至关重要的生命进程不仅由蛋白质相对丰度控制,更重要的是被时空特异分布的、可逆的翻译后修饰所调控,因而揭示翻译后修饰发生规律是解析蛋白质复杂多样的生物功能的一个重要前提。由于蛋白质发生修饰后其分子质量会发生相应的改变,同时质谱能够精确测定蛋白质或多肽分子质量,根据这一特性,开始将质谱应用于蛋白质翻译后修饰的鉴定。但由于翻译后修饰的蛋白质在样本中含量低且动态范围广,检测前首先需要对修饰蛋白质或肽段进行富集,然后才能进行质谱鉴定。磷酸化涉及到细胞信号转导,细胞的增殖,发育和分化过程;糖基化在细胞的免疫保护等 生物过程中起重要作用;组蛋白的甲基化和乙酰化与转录调节有关…

  

实验流程



 


技术平台

        Triple TOF 5600, Q-Exactive, Orbitrap Fusion™Tribrid™
我们的优势

        可以针对多种样本类型;

        可鉴定多种修饰类型;

        可以进行多组样品比较;

        富集效率高、特异性强;

        定性、定量结果准确.

应用领域

       疾病机理研究

       个性化医疗

       农业品种改良

       信号转导途径分析




        

生信分析

  


样要求


样品类型

样品要求(/组样品)

备注

蛋白质溶液

蛋白质总量≥300µg

重复实验则量翻倍,建议准备两份样品备用。

组织样品

样品总量≥0.1g

按照蛋白质组织提取效率(蛋白:组=7%

细胞样品

细胞数量≥107

胰酶消化,按细胞冻存标准离心收集细胞即可。

体液样品

清≥200µL,脑脊液≥200µL,尿液≥1mL ,泪液≥1mL.

 


案例一:血小板抑制相关信号通路研究

      利用iTRAQ蛋白质组学相对定量方法,筛选在血小板激活和抑制生理过程中的主要调节因子的磷酸化修饰差异。在利用伊洛前列素(环前列腺素类似物)治疗后,共鉴定了2700个磷酸化肽段,其中360个肽段在刺激过程中表达上调。进而发现血小板抑制是一个多因素的过程,包括了不同激酶和磷酸酶,以及一些其它蛋白质和信号通路的参与




参考文献:

            Beck, F., et al. (2014) Time-resolved characterization of cAMP/PKA-dependent signaling reveals that platelet inhibition is a concerted process involving multiple signaling pathways. Blood 123, e1-e1.



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