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I-Sanger生信云 RNA-Seq 2.0上线了

公司新闻2017-06-09

各位小伙伴们,你是否也经历过或正在经历着以下困扰?

数据下机了,想自己搞分析,却没有服务器,想做做不了;

有了服务器,可是Linux、R、Python那么复杂,想想就头大;

交给公司,交付了那么多结果文件,怎么把那些结果文件关联起来;

费了吃奶的劲分析数据,想做炫酷的图,反馈给公司,却要等待好久......


I-Sanger旗下RNA-Seq 2.0上线了

I-Sanger生信云将您带入科研服务2.0时代,您无需配置Linux操作系统,安装复杂的分析软件,下载大量的数据库,只需在I-Sanger生信云平台中选择相应的分析流程和数据库,设置计算参数,即可在线进行生信分析,生成准确、详细、专业的交互分析报告。

 

RNA-Seq 2.0可以实现一些什么功能呢?基因功能查询、表达量分析、基因差异分析、基因集分析、SNP分析、可变剪切分析等。只是这样?当然不是,每一项分析还可以自定义参数、选择不同软件、自定义想要的基因集合,随心所欲搞定您想要的分析,实现数据挖掘就在鼠标点击之间。我们的目标是:转录组分析不求人,一键搞定全流程。


先不多说了,我们来看看平台长什么样子吧。

 

选择实际的数据,点‘交互分析’进入。


交互分析页面

进入交互分析页面,在左侧导航栏,可以看到分析项列表,想看哪里点哪里,SO EASY!小伙伴说人家想下载下来慢慢看,没问题!那就点击右上角的“查看结果目录”和“查看/打印报告”咯!!

这么多分析项,我们先来展示一下几个比较重要的部分:

一、功能查询

实现查询特定功能对应的基因/转录本信息,或根据基因/转录本信息检索其功能,帮助您迅速锁定所需信息。在“功能查询条件”中输入关键字,点击“搜索”,您想要的结果就会出现了,点击“加入基因集”就可以保存起来,可供后用啦!


 

二、差异表达分析


差异基因数太多或太少!? 想自己换个筛选方案,改改条件,还想换个差异分析软件试试,可以么?当然可以,我们来试试!


 

下面这个比较重要哦!


三、基因集分析

所谓基因集就是根据一定的筛选条件(比如功能、表达量、表达差异情况,以及任意您感兴趣的基因),所获得的基因(或转录本)集合。目的是从众多表达的基因/转录本中挖掘出与研究目的或表型相关的一些基因(或转录本),并进行功能、表达等研究。页面如下:

基因集分析内容:

基因集分析内容

作用

Venn图

鉴别基因集间共有和特有的基因/转录本

聚类分析

① 实现基因集中基因/转录本在各样本中表达的可视化;

②根据基因/转录本在各样本中的表达,将基因/转录本进行聚类,基于表达模式相似的基因/转录本通常具有功能相关性,推断未知基因/转录本的功能。

功能分类

①单一基因集中基因的功能研究

②不同筛选条件获得基因集的功能比较分析

功能富集

对基因集中的基因进行功能富集分析,获得该基因集中的基因主要具有哪些功能或主要参与哪些代谢通路,包括GO富集分析和KEGG富集分析

蛋白互作网络图

研究基因间是否存在相互作用,基于基因对应的蛋白信息进行分析

这项功能是不是很实用呢!


额,都怪小编太认真,这里还有难搞的可变剪切分析哦!

经过数月辛苦的研发,我们的可变剪切分析更高大尚啦,获得可变剪切的分类算什么,差异可变剪切搞起来。


还有,想研究转录本的伙伴们看过来,我们的云平台照样可以玩转它!


好啦,小编也不占用大家太多时间了,这次先说这么多,后边我们再详细地给大家介绍每一部分的功能哦。


担心不会操作?我们还会提供在线培训啦。培训时间呢,近期就会开始哦。培训后还会有账号开通,体验demo数据操作,一切尽在计划中啦......尽请期待吧!

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